11.4-其他组学.pdf

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1、其他组学 其他组学 代谢组学 免疫组学 糖组学 脂类组学 组学 其他组学 代谢组和代谢组学 代谢组学 代谢组(metabolome)是指某一细胞、组织、器官或体液中所产生的所有代谢组分，尤其是相对分子质量为1000以内的小分子物质。代谢组学(metabonomics/metabolomics)是指通过对某一细胞、组织、器官或体液内（尤其是小分子）代谢物进行高通量检测、定性和定量分析，研究生物体整体或组织细胞系统的动态代谢变化，尤其是内源代谢、遗传变异、环境变化及各种物质进入代谢系统的调整和影响，并寻找代谢物与生理病理变化相对应关系的研究方式的科学。其他组学 代谢组学 代谢组学同以基因、RNA和

2、蛋白质为研究对象的基因组学、转录组学和蛋白质组学一样，是系统生物学(System Biology)重要组成部分。DNA 基因组 Genome 基因组学 Genomics RNA 转录组 Transcriptome 转录组学 Transcriptomics 蛋白质 Protein 蛋白质组 Proteome 蛋白质组学 Proteomics 代谢物 Metabolite 代谢组 Metabolome 代谢组学 Metabolomics 细胞 Cell 组织 Tissue 器官 Organ 个体 Individual 表型 Phenotype 系统生物学 System Biology 其他组学 代

3、谢异常与疾病 代谢组学 生命体的本质特征是代谢。代谢异常不仅是疾病的一种重要表现形式，也是疾病发生发展的重要机制。蛋白质功能障碍是代谢异常发生的基本分子基础。代谢异常可在多水平通过多种途径引起。其他组学 应用 代谢组学 与疾病诊断：病理生理变化致代谢产物变化，寻找疾病标记物 与心脑血管疾病：冠心病和高血压疾病等 与肿瘤：适当肿瘤标记物，早期诊断和治疗 与肝肾功能疾病：重要代谢器官，病变时涉及代谢物组变化 与内分泌系统疾病：血清和尿代谢物组变化与诊断相关性 与食品安全：代谢水平检测转基因农作物和普通农作物 器官移植、临床生殖、营养/药物代谢和环境检测等 高通量检测实验和大规模计算为特征 其他组学

4、 免疫组学(immunomics)重点研究免疫相关的全套分子、作用靶分子及其功能。包括免疫基因组学、免疫蛋白质组学和免疫信息学三方面的研究。其他组学 糖组学(glycomics)是从分析和破解生物体或细胞全部糖链所含信息入手，研究糖链的分子结构、表达调控、功能多样性以及与疾病关系的学科领域。脂类组学(lipidomics)是代谢组学的一个分支，是用系统的方法分析所有的脂类，与其相互作用的分子，以及在生物体内的作用的一个研究领域。其他组学 生物信息学(bioinformatics)是一门新的前沿交叉学科，采用数理和信息科学的理论、技术和方法研究生命现象，理解和组织与生物分子相关的信息，包括生物信

5、息采集、处理、存储、传播、分析和注释等。生物信息学 研究平台：数据库、计算机网络和应用分析软件 研究目标：破译DNA序列遗传语言 揭示基因组信息结构复杂性和基因表达规律 认识生命活动的基本规律 发现生命起源、进化、遗传和发育的本质 揭示生理和病理过程的分子基础 其他组学 主要任务 生物信息学 获取完整基因组序列 发现新基因和新SNP位点 获取蛋白质组学信息 蛋白质结构预测 生物信息分析技术与方法研究 其他组学 研究内容 生物信息学 生物分子数据的收集、存储和管理 数据库查询及序列比对分析 分子进化和基因组比较研究 发现新基因及基因单核苷酸多态性 基因组序列信息提取和分析 功能基因组相关信息的提

6、取和分析 蛋白质结构比对/预测 蛋白质组/结构蛋白质组学研究 药物/新药设计 生物信息分析技术与方法研究 基因识别非编码区生物信息分析方法 其他组学 常用生物信息学数据库简介 生物信息学 核酸数据库 序列数据库(GenBank,EMBL,DDBJ)、二级数据库(EPD,TransFac,dbSNP)和晶体数据库(NDB)蛋白质数据库 序列数据库(PIR-PSD,SWISS-PROT,TrEMBL,UniProt,UniRef,UniParc)和结构数据库(DSSP,PROSITE,PRINTS,Blocks,Pfam,ProDom,SMART,InterPro,PDB)其他组学 常用生物信息学

7、数据库简介 生物信息学 非编码RNA组科学数据库(NONCODE)序列比对工具 BLAST检索和ClustalW数据库 其他在线生物信息学分析工具 KEGG、DAVID、GeneGo、Panther和Ingenuity(IPA)等 其他组学 在功能基因组学中的应用 生物信息学 利用生物信息学所提供信息分析，再根据不同目的采用不同研究手段，在基因组水平上全面分析基因功能。发现新基因：基因区域和基因功能预测 解读序列（BLAST发现相似序列等）基因组编码区预测 数据库相似性搜索法 相关数据库的使用 其他组学 NCBI Home https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/其他组学 数据库包括迄今所有已知人类遗传病、遗传决定性状及其相关基因，各种疾病临床特征、诊断、鉴别诊断、治疗和预防等相关信息，已知有关致病基因的连锁关系、染色体定位、组成结构和功能及动物模型等资料，并附参考文献。OMIM 制定的各遗传病、性状和基因的统一编码系统为全球公认。