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1、一、CTAB法提取DNA主要试剂及配方:CTAB缓冲液(2%):试剂用量(g/L)CTAB20NaCl81.816Tris-base7444EDTA-Na212.114巯基乙醇 23mLpH 8.0 称量好后65水浴,搅拌,直至完全溶解,然后定容,调pH24:1溶液:24:1为体积比,如果是一瓶新的三氯甲烷(500mL),可直接加入21mL异戊醇即可。70%乙醇:二、CTAB法提取DNA的简要步骤步骤备注1将新鲜叶片叶脉去掉,剪碎置于研钵中,加入液氮快速研磨成粉末状,转入2mL离心管,加入65预热的CTAB提取液900 uL充分混匀,65保温40 -60min,在此期间轻轻颠倒离心管几次。加入
2、CTAB后,需及时充分混匀,然后水浴。开始混匀可以使劲,后面的混匀要轻,保证DNA的完整性。此步骤是裂解细胞,释放细胞产物2水浴完后,冷却至室温,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1)混合液轻轻摇动10 min。12000 r/min离心10 min;第一次抽提24:1尽量加满2mL的离心管,摇和离心的时候尽量轻拿轻放。此步骤是用氯仿抽提有机相,异戊醇的作用是去除气泡。3取上清液,再用等体积的氯仿/异戊醇抽提一次,12000 r/min离心10 min;离心后,DNA溶于上层水相,变性蛋白溶于下层氯仿,第二次24:1抽提加1mL即可。4小心吸出上清液于另一2mL离心管中,加入0.6倍上清液体积的
3、异丙醇,缓慢混匀,于-20冰箱中沉淀DNA;第二次吸上清尽量不要吸到中间层,按需要浓度大小,可选择性吸取。异丙醇用前需预冷。5挑出成团的DNA,用70乙醇洗23次;挑出的DNA还是含有一定的杂质,因此,第一次70%乙醇洗时间建议长些,一般不低于10分钟,期间上下摇晃几次,但不可太长,否则DNA要断裂6无水乙醇洗1次;7倒干残余乙醇,自然干燥也可以进行真空干燥8加无菌水溶解DNARNA酶可以加到水中,溶解DNA9 RNA去除,按100微升DNA溶液加1微升RNA酶10溶解后放置几小时后(尽量过夜)便可电泳检测,浓度测定三、提取过程中可能出现的一些情况(主要是提玉米DNA)可能出现的情况可能原因建
4、议第一次24:1抽提后上清是绿色的浑浊液体。样取的较多1、样品取样适量;2、加CTAB时可以适量多点。第一次上清是褐色的(正常情况应该是浅黄色,透明)样品在裂解过程中被氧化了或是降解了。取样的时候尽量取了及时放在液氮中;确定巯基乙醇按比例加在了CTAB缓冲液中;再者,样磨完了加CTAB缓冲液的时候速度要快,混匀要充分;如果机器磨样,尽量倒出钢珠,再加CTAB缓冲液。加入异丙醇后没见絮状沉淀取样太少;样品碾磨不够好12000r/min离心2min,一般都会有沉淀附着管壁,同样可以收集到DNA。DNA电泳检测时候有拖尾,点样孔不干净拖尾是DNA降解,点样孔不干净是含有部分蛋白对于这两种情况,只能尽
5、量做好每一步,减少每一步不必要的影响四、10TBE配方Tris-base108g/L硼酸55 g/LEDTA-Na27.444 g/LpH 8.02提 . / 主 要 / 及硼/方 -配 0影的步每步好尽,况蛋分是干点解 干孔点尾测电 收样壁着有般, 离 0够磨品沉状见液冲 再,倒样磨如充,度候冲 磨样中缓 比乙巯定液时取量了降了化过裂明,浅应情正褐清点量适 加 量较体液的绿提: 建原情现 玉要况的现中测度测泳便过后置解 微溶 微按除 解溶加可 解水干空干自乙残次 断 否可次晃间期分不,议间乙 次此杂一有 次醇0用 团冷预醇异吸选大浓按中吸尽吸 沉冰-于缓丙积液 0中离 另上吸可 加 二,于白,层于 0心 00,一戊氯体用液泡气用醇异机抽是此放量时离和管 量 离 0 动轻混 异氯积加室冷后产胞,胞骤此整 证要的后使匀。后匀混需 次管离轻此在 -温保 分 取 心 转状磨速入中于碎去脉备步步简 取 醇醇可可戊 加, 烷三一是积为液 ,定解溶,后称. 醇 试) 液