王镜岩 生物化学 经典课件 13氨基酸合成 考研必备 学生物化学必备.ppt

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1、第31章,氨基酸及其重要衍生物的生物合成,一、概论,(一)氨的来源,(二)碳骨架的来源,(三)生物固氮,红色为固氮菌类菌体,蓝色为类菌体周膜,黄色和绿色为被感染细胞的细胞核。,硝酸盐同化酶结构域的序列构成,硝酸盐和亚硝酸盐还原酶的辅基:(a)硝酸盐还原酶的钼辅因子,钼的载体为喋啉衍生物。(b)是卟啉的衍生物,羧基可以作为氢离子的供体,将亚硝酸盐还原为铵盐。,从固氮酶发现的两种金属串:(a)P-串,2个Fe4S3串共用第四个硫,并以二硫键与蛋白质相连。(b)FeMo辅因子,这一新的Fe-S复合物含有1个Mo,7个Fe和9个S,通过Mo和Fe与蛋白质相连。,打破3个共价键需要大量的能量,固氮酶催化

2、的反应,a.固氮酶还原酶(铁蛋白)的带状图解,左侧为ATP结合部位,右侧为Fe4S4结合部位。b.固氮酶还原酶与固氮酶二聚体形成的复合物,固氮酶还原酶(绿色和黄色)的Fe4S4中心靠近固氮酶二聚体(红色和蓝色),P-串和FeMo辅因子位于其中。,(四)固氮反应的调控,(五)固氮的基因表达调控1.自身固氮克氏杆菌的固氮基因研究的较深入,其固氮基因群除固氮酶基因nifHDK外,nifE,nifN,nifB和nifQ与FeMoco的加工或装配有关,nifS及nifU的产物参与FeMoco的加工和装配,nifM的产物参与FeMoco的加工成熟,nifF和nifJ的产物与固氮酶系的电子传递有关,nifL

3、A是调控基因。2.共生固氮根瘤菌的结瘤基因nodA,B,C是细胞分裂和宿主根毛弯曲所必需的,核苷酸序列较保守,nodEF,nodG,nodH或nodLMN参与宿主的选择,与根毛弯曲的位置,细胞分裂的效率和持久性有关。固氮基因分为nif基因和fix基因两群,前者与克氏杆菌的固氮基因相似,后者的功能有待进一步研究。豆科植物的早期结瘤素基因与根瘤的早期形成有关,晚期结瘤素基因表达多种酶和一些功能不清的结瘤素。,(六)生物固氮的基因工程1.使非豆科植物转变为固氮作物(1)将豆科植物的结瘤基因导入其它作物,使其能够感染固氮菌。(2)改变根瘤菌的遗传结构,使其能够感染其它作物。(3)将固氮基因导入非豆科植

4、物。由于固氮酶复合体对氧的抑制作用十分敏感,消耗大量的ATP,这一领域还有不少问题要研究解决。2.提高现有固氮作物的固氮能力(1)将固氮效率高的根瘤菌固氮基因族导入结瘤能力强的根瘤菌中。(2)将外源共生基因导入根瘤菌中,提高其结瘤能力或固氮能力。(3)培育抗药的根瘤菌。,二.氨基酸的生物合成,L-谷氨酸的生物合成,L-谷氨酰胺的生物合成,(一)谷氨酸族氨基酸的生物合成:L-谷氨酸,L-谷氨酰胺,L-脯氨酸,细菌谷氨酰胺合成酶的结构:(a)十二聚体由两个六聚体组成。(b)谷氨酰胺合成酶的分子结构。,谷氨酰胺合成酶的共价修饰,12个单体可以被逐步腺苷酸化而失活。,循环串联系统调控谷氨酰胺合成酶的共

5、价修饰,谷氨酰胺合成酶的反馈抑制别购调控,L-脯氨酸的生物合成,细菌合成鸟氨酸的途径,氨基移换酶的作用机制,氨甲酰磷酸合成酶,即NH3-依赖的线粒体CPS同工酶的作用机制。,鸟氨酸经过尿素循环生成瓜氨酸和精氨酸,蕈类和眼虫L-赖氨酸的生物合成途径,高柠檬酸,顺-高乌头酸,高异柠檬酸,-酮己二酸,-氨基己二酸,6-腺苷基-氨基己酸,-氨基己酸-半醛,酵母氨酸,(二)天冬氨酸族的生物合成:L-天冬氨酸,L-天冬酰胺,L-甲硫氨酸,L-苏氨酸,L-天冬氨酸的生物合成,L-天冬酰胺的生物合成,L-甲硫氨酸,L-苏氨酸和L-赖氨酸的生物合成途径,胱硫醚,琥珀酰二氨基庚二酸,琥珀酰-2-氨基6酮庚二酸,六

6、氢吡啶-2,6-二羧酸,二氢吡啶-二羧酸,消旋二氨基庚二酸,二氨基庚二酸,由甲硫氨酸合成的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是多胺转移反应和多胺合成反应的甲基供体,腐胺(丁二胺),亚精胺,(三)丙酮酸族的生物合成:L-丙氨酸;L-缬氨酸、L-亮氨酸;,L-缬氨酸、L-异亮氨酸的生物合成,L-亮氨酸的生物合成,(四)丝氨酸族的生物合成:L-丝氨酸、L-甘氨酸、L-半胱氨酸的生物合成及固硫作用,L-丝氨酸的生物合成,异丙基苹果酸,-酮异己酸,L-甘氨酸的生物合成,L-半胱氨酸的生物合成,硫的同化和产硫化合物的生物合成,(五)苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的生物合成,芳香族化合物由分枝酸转化而成,对氨基苯甲酸,邻

7、氨基苯甲酸,对羟基苯甲酸,预苯酸,质体醌,木质素,分支酸的生物合成,2-酮-3脱氧7-磷酸庚酮糖酸,5-脱氧奎尼酸,5-脱氧莽草酸,莽草酸,3-稀丙基莽草酸,分支酸,苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的生物合成,预苯酸,邻氨基苯甲酸,N-(5-磷酸核糖)-氨基苯甲酸,稀醇式L-(O-羧基苯氨酸)-L-脱氧核酮糖-5-磷酸,吲哚-3-甘油磷酸,由苯丙氨酸生成酪氨酸的途径,色氨酸合成酶是通道多酶复合体的一个典型的例子。,组氨酸的生物合成,5-磷酸核糖-4-酰胺-5-氨基咪唑核苷酸,N1-5-磷酸核酮糖亚氨甲基-5-氨基咪唑羧酰核苷酸,N1-5-磷酸核酮糖亚氨甲基-5-氨基咪唑-4-羧酰核苷酸,咪唑甘油磷酸,

8、咪唑丙酮磷酸,组氨醇磷酸,组氨醇,组氨酸,N1-5-磷酸核糖-ATP,N1-5-磷酸核糖-AMP,三、氨基酸生物合成的调节,(一)通过终端产物对氨基酸生物合成的抑制,(二)通过酶生成量的改变调节氨基酸的生物合成(参阅基因表达的调控),四、氨基酸转化为其他氨基酸及其他代谢物,(一)一氧化氮的形成,(二)谷胱甘肽(glutathion)的合成,(三)肌酸(creatine)的生物合成,胍基乙酸,(四)卟啉,血红素(Heme)的生物合成,-氨基-酮戊酸,-aminolevulinatesynthase(maincontroltargetforhemebiosynthesis),胆色素原,原卟啉,-氨

9、基-酮基己二酸,-氨基-酮基己二酸,-氨基-酮戊酸,谷氨酸半醛,-氨基-酮戊酸,胆色素原,前尿卟啉原,尿卟啉原,粪卟啉原,原卟啉原,原卟啉,胆绿素,胆红素*,胆红素二葡糖苷酸,尿胆素原,粪胆色素,尿胆素,*重要的抗氧化剂,(五)短杆菌肽S(gramicidinS),Theplantgrowthhormone,indole-3-acetate,isderivedfromTrp.,肉桂酸,Manyneurotransmittersarederivedfromaminoacids,基本要求1.熟悉生物固氮的基本过程(教材第32章)。2.熟悉氨基酸生物合成的基本过程。3.熟悉氨基酸生物合成的调节。4.熟悉氨基酸转化为其他重要代谢物的过程。,

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