山东省地方标准:鸭新型呼肠孤病毒病诊断技术规范(定稿).doc

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1、ICS 11.220B 41DB37山东省 地方标准DB 37/T XXXXXXXXX鸭新型呼肠孤病毒病诊断技术规范Diagnostic techniques for novel duck reovirus diseaseXXXX - XX - XX 发布XXXX - XX - XX 实施山东省市场监督管理局 发 布DB37/T XXXXXXXXXI前 言本标准按照GB/T 1.12009给出的规则起草。 本标准由山东省畜牧兽医局提出并组织实施。 本标准由山东省畜牧业标准化技术委员会归口。 本标准起草单位:山东省农业科学院家禽研究所。 本标准主要起草人:于可响、宋敏训、李玉峰、马秀丽、刘存霞、

2、姜亦飞、胡峰、亓丽红、黄兵、 郭效珍、刘玉山。DB37/T XXXXXXXXX1鸭新型呼肠孤病毒病诊断技术规范1 范围本标准规定了鸭新型呼肠孤病毒病的临床诊断、实验室诊断和综合判定技术规范。 本标准适用于鸭新型呼肠孤病毒病的诊断和流行病学调查。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本 文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB 19489 实验室生物安全通用要求 NY/T 541 兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范3 术语和定义下列术语和定义适

3、用于本文件。3.1 鸭新型呼肠孤病毒病 又称“肉鸭脾坏死症”、“番鸭出血性坏死性肝炎”,是由鸭新型呼肠孤病毒引起的多品种雏鸭 脾脏出血和坏死为主要特征的疾病。该病毒在血清学和基因序列上与原有的番鸭呼肠孤病毒有明显差 异。4 临床诊断4.1 流行病学该病一年四季均可发生,不同品种的鸭均可发病,如樱桃谷鸭、麻鸭、番鸭、半番鸭等;发病日 龄一般为525日龄,其中以510日龄居多,病程57天。4.2 临床症状病鸭精神沉郁,发育不良,部分拉白色稀粪,一般不会出现神经症状,容易继发鸭疫里默氏杆菌、 大肠杆菌等细菌感染。发病率5 %35 %,死亡率20 %以下。4.3 病理变化脾脏表面出血或坏死是其主要病变

4、特征。4.4 结果判定DB37/T XXXXXXXXX2符合4.1流行病学特征,病鸭出现4.2临床症状和4.3病理变化,可判为鸭新型呼肠孤病毒病疑似病 例,应进行实验室确诊。5 实验室诊断除非另有规定,实验室诊断所用化学试剂均为分析纯;试验用水符合GB/T 6682二级水的规定;实 验室生物安全要求按照GB 19489执行。5.1 病原分离鉴定5.1.1 仪器和设备5.1.1.1 高速冷冻离心机。 5.1.1.2 恒温培养箱。5.1.2 试剂或材料5.1.2.1 青链霉素(青霉素 10 000 IU/mL,链霉素 10 000 g/mL)。 5.1.2.2 0.22 m 微孔滤器。 5.1.2

5、.3 8 日龄9 日龄鸭新型呼肠孤病毒抗体阴性鸭胚。5.1.3 病料处理按NY/T 541要求无菌采集发病鸭的脾脏1 g2 g,加入10倍体积生理盐水和终浓度2 000 IU/mL的 青链霉素,剪碎后充分研磨,反复冻融2次3次,8 000g离心20 min,取上清液用0.22 m微孔滤器 过滤,经菌检无菌后用于病原分离。5.1.4 操作步骤5.1.4.1 取 5.1.3 中处理好的上清液经尿囊腔接种 8 日龄9 日龄鸭新型呼肠孤病毒抗体阴性鸭胚, 0.1 mL/枚,共 5 枚。封口后置于 37 恒温箱继续孵化,每日照胚两次,记录鸭胚死亡情况,观察到 第 6 天。 5.1.4.2 弃掉接种后 2

6、4 h 内死亡的鸭胚,若接种 6 天内鸭胚出现死亡,则收集死亡鸭胚的尿囊液, 用 5.2、5.3、5.4 中的任意一种方法进行鉴定;若接种 6 天内鸭胚不出现死亡,则收集 6 天活胚的尿 囊液,用 5.2、5.3、5.4 中的任意一种方法进行鉴定。5.1.5 结果判定5.1.5.1 阳性:接种后死亡鸭胚或接种后 6 天活胚的尿囊液用 5.2、5.3、5.4 中的任意一种方法检测 为阳性。 5.1.5.2 阴性:接种后死亡鸭胚或接种后 6 天活胚的尿囊液用 5.2、5.3、5.4 中的任意一种方法检测 为阴性。5.2 RT-PCR 方法5.2.1 仪器和设备5.2.1.1 高速冷冻离心机。 5.

7、2.1.2 PCR 扩增仪。 5.2.1.3 电泳仪。DB37/T XXXXXXXXX35.2.1.4 紫外分析仪。5.2.2 试剂或材料5.2.2.1 TRIZol。 5.2.2.2 无 RNA 酶水。 5.2.2.3 反转录酶 M-MLV。 5.2.2.4 RNA 酶抑制剂。 5.2.2.5 Taq 酶。 5.2.2.6 琼脂糖。 5.2.2.7 Goldview DNA 染料。 5.2.2.8 阳性参照物(鸭新型呼肠孤病毒)。 5.2.2.9 阴性参照物(阴性尿囊液)。5.2.3 操作步骤5.2.3.1 样品处理按NY/T 541要求无菌采集发病鸭的脾脏1 g2 g,加入10倍体积生理盐

8、水,用剪刀剪碎后,置于 研磨器中充分研磨,反复冻融2次3次,8 000g离心10 min,取上清液100 L用于RNA提取。5.2.3.2 RNA 提取5.2.3.2.1 在 100 L 病料上清液中加入 1 mL TRIZol,剧烈颠倒 50 次100 次,室温静置 10 min 后, 加入 200 L 氯仿,上下颠倒 50 次100 次,室温静置 5 min10 min,12 000g 离心 10 min。 5.2.3.2.2 吸取上清加入等体积氯仿,上下颠倒 50 次100 次,12 000g 离心 10 min。 5.2.3.2.3 吸取上清加入等体积的异丙醇,轻轻混匀后,-20 静置

9、至少 30 min,然后 12 000g 离心 15 min20 min。 5.2.3.2.4 弃上清液,加入 1 mL 75 %酒精,12 000g 离心 5 min10 min。 5.2.3.2.5 弃上清液,倒置自然晾干,或 12 000g 再离心 5 min,吸掉管底部的液体。 5.2.3.2.6 沉淀用 20 L 无 RNA 酶水溶解,备用。阳性和阴性参照物 RNA 的提取同上。样品 RNA 提取 也可使用同等效果的商品化试剂盒。5.2.3.3 引物上游引物P1:5 TCATTCATTTGGGCAGCGG 3 下游引物P2:5 AGTAGTGTGTAAAGCATGGACT 35.2.

10、3.4 RT-PCR 扩增5.2.3.4.1 反转录(RT)反应反应体系为10 L。在PCR管中加入dNTP(10 mmol/L) 0.8 L,引物P1(20 mol/L) 0.5 L,引物 P2(20 mol/L) 0.5 L,RNA 5.0 L,放PCR仪中70 作用5 min,然后取出冰浴1 min2 min,再加 入RNA酶抑制剂(40 U/L) 0.5 L,反转录酶M-MLV(200 U/L) 0.7 L,5M-MLV buffer 2 L,继续 放PCR仪中42 30 min,95 2 min。5.2.3.4.2 PCR 扩增5.2.3.4.2.1 反应体系DB37/T XXXXX

11、XXXX4反应体系为50 L,配制见表1。表 1 PCR 反应体系配制反应体系中各成分每个样品反应组分用量/L10PCR buffer4.520 mol/L 引物 P10.520 mol/L 引物 P20.5RT 产物5.05 U/L Taq E0.5ddH2O39.0总体积50.05.2.3.4.2.2 反应程序采用以下反应程序进行扩增: 第一阶段:95 3 min; 第二阶段:95 20 s,55 20s,72 30 s,共进行 30 个循环; 第三阶段:72 10 min。 RT-PCR扩增也可使用商品化的RT-PCR试剂盒,按说明书要求操作。5.2.3.5 电泳取PCR扩增产物6 L与

12、10上样缓冲液1 L混合,加入到1.5 %的琼脂糖凝胶孔中,同时在旁边点 样孔中加入2 000 bp Ladder Marker(分子量标准物)10 L,以5 V/cm电压进行电泳25 min30 min,在紫外分析仪上观察结果。5.2.4 结果判定5.2.4.1 试验成立条件在阳性对照出现一条大小226 bp的单一条带,同时阴性对照无此条带的情况下,检测结果成立。5.2.4.2 结果判定被检样品出现与阳性对照同样大小的条带时,判为阳性;被检样品未出现与阳性对照同样大小的 条带时,判为阴性。参见附录A。5.3 荧光 RT-PCR 方法5.3.1 仪器与设备5.3.1.1 高速冷冻离心机。 5.

13、3.1.2 荧光定量 PCR 扩增仪。5.3.2 试剂或材料5.3.2.1 TRIZol。 5.3.2.2 无 RNA 酶水。 5.3.2.3 SYBR Green 荧光 RT-PCR 反应液(2SYBR Premix)。DB37/T XXXXXXXXX55.3.2.4 阳性参照物(鸭新型呼肠孤病毒)。 5.3.2.5 阴性参照物(阴性尿囊液)。5.3.3 操作步骤5.3.3.1 样品处理参见5.2.3.1。5.3.3.2 RNA 提取参见5.2.3.2。5.3.3.3 引物上游引物P3:5 ATCGCACTATTGACGCACTT 3 下游引物P4:5 TTGACGACGCCAATCCC 3

14、5.3.3.4 荧光 RT-PCR 扩增5.3.3.4.1 反转录(RT)反应 参见5.2.3.4.1。5.3.3.4.2 荧光 PCR5.3.3.4.2.1 反应体系反应体系为25.0 L,配制见表2。表 2 荧光 PCR 反应体系配制反应体系中各成分每个样品反应组分用量/L2SYBR Premix12.520 mol/L 引物 P30.520 mol/L 引物 P40.5RT 产物1.0ddH2O10.5总体积25.05.3.3.4.2.2 反应程序采用以下反应程序进行扩增: 第一阶段:95 45 s; 第二阶段:95 10 s,56 10 s,72 15 s,40 个循环,每次循环在 7

15、2 延伸时收 集荧光。 荧光RT-PCR扩增也可使用商品化的Real-time RT-PCR试剂盒,按说明书操作。 反应结束后根据分析软件得出的Ct值和扩增曲线来判定结果。5.3.4 结果判定5.3.4.1 试验成立条件DB37/T XXXXXXXXX6在阳性对照的Ct值33且出现典型扩增曲线,阴性对照Ct值35的情况下,试验成立。5.3.4.2 结果判定当被检样品Ct值33且出现典型扩增曲线时,判为阳性;当被检样品无Ct值或者Ct值35时,判 为阴性;当被检样品Ct值在33-35之间时判为可疑,需重做,再次检测结果的Ct值35,且出现典型扩 增曲线,则判为阳性,否则判为阴性。参见附录B。5.

16、4 RT-LAMP 方法5.4.1 仪器与设备5.4.1.1 高速冷冻离心机。 5.4.1.2 水浴锅。 5.4.1.3 紫外分析仪。5.4.2 试剂或材料5.4.2.1 TRIZol。 5.4.2.2 无 RNA 酶水。 5.4.2.3 甜菜碱(betaine)。 5.4.2.4 TritonX-100。 5.4.2.5 反转录酶 AMV。 5.4.2.6 RNA 酶抑制剂。 5.4.2.7 Bst DNA 聚合酶。 5.4.2.8 SYBR Green染料。 5.4.2.9 阳性参照物(鸭新型呼肠孤病毒)。 5.4.2.10 阴性参照物(阴性尿囊液)。5.4.3 操作步骤5.4.3.1 样

17、品处理参见5.2.3.1。5.4.3.2 RNA 提取参见5.2.3.2。5.4.3.3 引物RT-LAMP检测引物序列见表3。表 3 RT-LAMP 引物序列引物名称序列(5-3 )NDR-F3TGAGATATATTAGGGTGGGTCNDR-B3GACATGCCTAGTATGGAGCATNDR-FIPagcgatatcctgaggttgctTTTGCCATTGCTCTGCATGTCNDR-BIPaggcgaggatatgacgc TTTTCATCGATCATCTTCCAACCCDB37/T XXXXXXXXX75.4.3.4 RT-LAMP 扩增5.4.3.4.1 反应体系反应体系为25.

18、0 L,配制见表4。表 4 RT-LAMP 反应体系配制PCR 反应体系中各成分每个样品反应组分用量/L10Bst buffer2.510 mmol/L dNTP1.025 mmol/L MgCl23.05 mol/L Betaine2.010 mol/L 外引物 NDR-F30.510 mol/L 外引物 NDR-B30.540 mol/L 内引物 NDR-FIP1.040 mol/L 内引物 NDR-BIP1.040 U/L RNA 酶抑制剂1.05 U/L 反转录酶 AMV1.08 U/L Bst DNA 聚合酶1.0RNA5.0无 RNA 酶水5.5总体积25.05.4.3.4.2 反

19、应程序采用以下反应程序进行扩增: 第一阶段:63 45 min; 第二阶段:85 2 min。5.4.4 结果判定5.4.4.1 试验成立条件反应结束后,取1 L 10倍稀释的SYBR Green加入产物中,混匀后在紫外线下观察。在阳性对 照出现黄绿色荧光,同时阴性对照不出现黄绿色荧光的情况下,试验成立。5.4.4.2 结果判定在紫外线下被检样品出现黄绿色荧光,判为阳性;在紫外线下被检样品未出现黄绿色荧光,判为 阴性。参见附录C。6 综合判定符合临床诊断规定的疑似病例经5.2、5.3、5.4中的任一方法检测,结果为阳性者,可判定为鸭新 型呼肠孤病毒病。DB37/T XXXXXXXXX8A A附

20、 录 A (资料性附录) RT-PCR 结果电泳图RT-PCR结果电泳图见图A.1。说明:MDNA Marker DL2000;1阳性对照;2临床样品1;3临床样品2;4阴性对照。图 A.1 RT-PCR 结果电泳图DB37/T XXXXXXXXX9B B附 录 B (资料性附录) 典型扩增曲线示意图典型扩增曲线示意图见图B.1。说明:1阳性对照;2临床样品1;3临床样品2;4阴性对照。图 B.1 典型扩增曲线示意图DB37/T XXXXXXXXX10C C附 录 C (资料性附录) RT-LAMP 结果示意图RT-LAMP结果示意图见图C.1。说明:1阳性对照;2临床样品1;3临床样品2;4阴性对照。图 C.1 RT-LAMP 结果示意图_

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