RT-PCR步骤.pdf

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1、 RNA 提取(-80保存)1.取 50-100mg组织加入 1ml Trizol,剪碎,振荡 30s 2.转入一新 EP 管中(),室温保存 5min 3.加氯仿,振荡混合(手摇剧烈),室温放置 5min 4.12000 rpm 4离心 15min 5.转移上层水相(吸 70%)到一新 EP 管中,加异丙醇,振荡混合,室温保存 10min 6.12000rpm 4 离心 15min 7.倒掉上清,加 1ml 75%无水乙醇(4保存),振荡混合,7500rpm 4 离心5min 8.倒掉上清,室温或 37放置 20min(EP 管倒置在滤纸上)使 RNA 沉淀干燥 9.加 20ul DEPC

2、水至 EP 管中 10.在 50孵育 3-5min(或手握 3-5min),使 RNA 充分溶解 注意:操作过程中带手套口罩,所用到的仪器设备须经去除 RNA 酶处理(灭菌或 DEPC 水浸泡)测 RNA 浓度(以 750ul 体系为例)11.调零:750ul DEPC 水 12.测量:745ul DEPC 水+5ul RNA 13.总 RNA 浓度=OD26040稀释倍数(150 倍)ug/ml 14.=OD26040150 ug/ml 15.=OD2606 ug/ul 16.A260/A280 应在之间 逆转录(cDNA:一周内-20保存,长期-80保存)方法一:以通用试剂盒为例,反应体系

3、 20ul 1.RNA 短暂离心 2.RNA 模板,再加入 Oligo(dt)1ul,加 DEPC 水补齐至 10ul.轻轻混合均匀,短时间离心 3.将反应液置于 65 5min 冰上 1min,短时间离心 4.按顺序加入:5buffer 4ul 200ul 核糖核苷酸酶抑制剂 10mm dNTP MIX 1ul 逆转录酶 1ul RNase-free H2O 轻轻混合均匀,短时间离心 5.将混合物置于 37,60min 6.75加热 15min,中止上述反应,置于冰上 注意事项 1.RNA 提取和逆转录时所用器具均应在 1DECP 水中避光浸泡过夜,再高压烘干 2.DECP 水配制(先加 D

4、EPC,再加水,避光过夜,然后高压)3.75%无水乙醇配制(DEPC 水:无水乙醇=1:3)4.RNA 提取和逆转录时应全程佩戴一次性手套和口罩 聚合酶链反应 PCR(产物-20保存)方法一:125ul 的反应体系,冰上操作,稍后短时间离心 Template 1ul/3ul Primer 1 1ul Primer 2 1ul 10*Taq Buffer 5ul dNTPs(10mM)1ul Taq 酶 1ul ddH2O 补至 25ul 循环:94 5min 94 45s Tm+4 45s 72 45s 2 29-34(从第 2 步开始循环 30-35个循环)72 10min 4 12h PCR 结束后-20保存或置于冰上开始电泳。退火温度计算 2(A T)4(G C)正反义平均数,再上下波动度(4,或5)引物稀释方法 1.引物先离心,后用 DEPC 水或双蒸水稀释成 10 倍母液 2.再取 5ul 母液,加 45ulDEPC 水或双蒸水稀释 10 倍成操作液

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