生物化学知识梳理.pdf

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1、 生物化学知识梳理 生物化学 单 元 细目 要点 、白的构功 蛋质结与能 1.氨基酸与多肽 Amino acid and peptide(1)氨基酸的结构与分类(2)肽键与肽链 2.蛋白质的结构 protein(1)一级结构概念(2)二级结构 a螺旋(3)三级和四级结构概念 3.蛋白质结构与功 能的关系(1)蛋白质一级结构与功能的 关系(2)蛋白质高级结构与功能的 关系 4.蛋白质的理化性 质 蛋白质变性 3.DNA竟性及其应用(1)DNA变性和复性的概念(氢 键断裂)(2)核酸杂交(PCR)(1)mRNA(5帽子,3 POLY-A;遗传借息载体 前体为hnRNA)(2)tRNA(1 脅 5

2、环)含大it 稀有碱基(3)rRNA原核一5S,16S,23S构与 功能(nucleic acid)2.DNA的结构与功能(1)DNA碱基组成规律(2)DNA的一级结构(3)DNA双螺旋结构(右手螺旋 反向平行,螺距354nm,表面 有两沟,破基互补,疏水作用 力与氢键维持稳定)(4)DNA高级结构(趙螺旋,染色质基本单位-核小体)(5)DNA的功能(遗传信息的载 体)4.RNA结构与功能 -三 酶 1.酶的催化作用(1)酶的分子结构与催化作(高效性,专一性可调节性;(2)酶促反应的特点(3)酶-底物复合物 F用 2.辅酶与酶辅助因 子 酶的必须基团一 与酶活性密切相 关的基团,包括活性 中心

3、内与外的)(1)维生素与辅酶的关系(2)辅酶作用(3)金属离子作用(4)多酶体系 3.酶促反应动力学 米-曼方程(1)Km和Vmax的概念(2)最适pH值和最适温度 亠 4.抑制剂对酶促反 应(1)不可逆抑制(2)可逆性抑制-竞争性,非 四、糖代 谢 的抑制作用 竞争性,反竞争性-5.酶活性的调节(1)别构调节(2)共价修饰(3)酶原激活(4)同工酶概念 6.核酶 核酶的概念 1.糖的分解代谢 辅酶的调节(1)糖酵解的基本途径、关键 酶和生理意义(快速为机体提 供能量)glycolysis(2)糖有氧氧化的基本途径及 供能 aerobic oxidation(3)三羧酸循环的生理意义(-大物质

4、代谢的最终通路,三大物质代谢的联系枢纽,为 其它合成代谢提供前体物质)krebs cycle 2.糖原的合成与分 解(G-1-P)合成耗(1)肝糖原的合成一(糖原合 酶及UDP(焦磷酸)(2)肝糖原的分解一(磷酸化 能 ATP/UTP 酶)3.糖异生肌肉中缺 乏G-6-P酶 glue on eoge nesis(1)糖异生的基本途径和关 酶(3个能障)(2)糖异生的生理意义(保 血糖浓度)(3)乳酸循环cori cycle 灑 艮持 4.磷酸戊糖途径 pen tose phosphate pathway(G-6-P脱氢酶)NADPH(1)磷酸戊糖途径的关键酶 重要的产物(2)磷酸戊糖途径的生理

5、意 宇和 录义 5.血糖及其调节 血糖来源一一食物,肝糖原,非糖物质甘 油、乳酸、氨基酸 去路氧化分 解,合成糖原,转变 为非糖物质,过高时 随尿排出)(1)血糖浓度(空腹 3.89-6.11mmol/l)(2)胰岛素的调节(降血糖 促进酶)(3)胰高血糖素的调节(4)糖皮质激素的调节 五、1.ATP与其他高能化(1)ATP循环与高能磷酸键(分 生物 氧化 合物 解可生成21KJ以上能量的磷酸 键)(2)ATP的利用(作为细胞直 接利用的能源物质)(3)其他高能磷酸化合物(不 生成ATP的氧化体系:抗氧化 酶体系清除反应活化氧类。)微粒体细胞色素P450单加氧酶 催化底物分子羟基化 RH+NA

6、DPH+H+CROH+NADROH 2.氧化磷酸化(1)氧化磷酸化的概念(指代 谢物脱下的氢,在呼吸链电子 传递过程中偶联ADP磷酸化,生成ATP,又称为偶联磷酸化。)(2)两条呼吸链的组成和排列 顺序 1、NADFf FMNFE3COO Cytb O Cytcl O Cytc O CuAo a,a 3O CuB O 2、FADHO琥珀酸O COO Cytb O Cytc1 O Cytc O CuAO a,a 3f CuEB O(3)ATP合酶(有疏水基团 F0,“a,b,c亚基”与亲水基团 F1“a,B,丫,亚基 与OSCPIF1”)c亚基可转动 转 动中B亚基有三种构像,O无活 性,亲和力

7、低;L无活性,与 ADP,Pi底物疏松结合;T型有 ATP合成活性(4)氧化磷酸化的调节三类 抑制剂-1、呼吸链抑制剂(鱼藤酮阻断FE-ST泛醌,抗 霉素A阻断cytb T泛醌,CO阻 断cyta 3T O)解偶联剂破坏电 化学梯度 ATP合酶抑制剂 抑制电子传递与ATP生成ADP 是调节速率的重要因素 八、脂类 代谢 1.脂类的生理功能(1)储能和供能(2)生物膜的组成成分(磷脂 双分子层)(3)脂类衍生物的调节作用 2.脂肪的消化与吸 收(1)脂肪乳化及消化所需酶(2)一脂酰甘油合成途径及乳 麋微粒 3.脂肪的合成代谢(1)合成的部位(胞液)(2)合成的原料(乙酰 COA(3)合成的基本途

8、径两步,1:丙二酰COA勺合成 4.脂肪酸的合成代 谢(1)合成的部位(胞液)(2)合成的原料(ATP,NADPH,乙酰 COA CO2 Mn2+)脂酸合成(缩合,加氢,脱水,再加氢)5.脂肪的分解代谢(1)脂肪动员(脂肪-HSL-FA 甘油)(2)脂肪酸3-氧化的基本过 程(脂酰肉碱转移酶)甘油-甘油激酶-磷酸甘油脱氢 酶-磷酸二羟丙酮 脂酰COA勺脱氢水化脱氢硫解-乙酰COA(3)酮体的生成、利用和生理 意义 乙酰乙 酸,B-羟丁酸,丙酮 HMGCO合酶/裂解酶,乙酰乙酰 COA合 酶 肾心脑一一乙酰乙酰COA硫激 酶/硫解酶+骨骼肌一一琥珀酰COA专硫酶(1)胆固醇的合成部位、原料 和关

9、键酶(SEF胞液)(2)胆固醇合成的调节(限 6.甘油磷脂代谢(1)甘油磷脂的基本结构与 类(卵磷脂-磷脂酰胆碱,丿 脂-磷脂酰乙醇胺,脑磷脂 磷脂酰甘油)(2)合成部位和合成原料 质网)降解一线粒体(磷脂酶A1,C,D,B1,B2)亍分 L、磷(内 A2,7.胆固醇代谢 酶(HN=MGCOA原酶),饥饿 与饱食一胆固醇一激素)7 一 I-IJ?/八/(3)胆固醇的转化(胆汁酸 类固醇激素,VITD前良,8.血浆脂蛋白代谢(1)血脂及其组成(2)血浆脂蛋白的分类及功(CM外源 TG,VLDL-内源 TG,LDL-血浆转变,HDL-RC LPL由 apoCII 激活 HL 需激活剂 LCAT 由

10、apo 活(3)高脂蛋白血症(空腹 小时甘油三脂超过 2.26mmol/l)LDL,VLDL 致AS(动脉粥样硬化)H 有抗AS作用 匕能 T 无 AI激 12 可导 DL 七、氨基 酸代 谢 1.蛋白质的生理功 能及营养作用(1)氨基酸和蛋白质的生理 能(1、维持细胞组织的生长 更新和修补2、参与多种生命 动3、作为能源物质供能)(2)营养必需氨基酸的概E功 侖活:和 种类(体内必须又不能自身合 成必须由食物供给的氨基酸 甲借来一本两色书”)(1)蛋白酶在消化中的作用“弹指一捡秘方”内肽酶弹性蛋白酶,胰蛋白酶 肠激酶酶原活化,糜蛋白酶 外肽酶羧基肽酶A水解除 脯,精,赖外的氨基酸,羧基 肽酶

11、B水解碱性氨基酸的末 端肽键)(2)氨基酸的吸收(丫-谷氨 酰基循环 丫-谷氨酰转移酶 位于细胞膜外其余酶位于胞 液)(3)蛋白质的腐败作用 脱羧基作用生成胺类物质(酪 氨酸-酪胺,组氨酸-组胺,苯 丙氨酸-苯乙胺,赖氨酸-尸胺,色氨酸-色胺)酪胺与苯乙胺可 转化为假神经递质(B羟酪胺,2.蛋白质在肠道的 消化、吸收及腐败作 用 真核细胞内氨基酸 降解途径一一溶酶 体内ATP非依赖途径 的降解,蛋白酶体内 ATP依赖途径的降解(需要泛素的参与)苯乙醇胺)干扰儿茶酚胺一一 肝性脑病 3.氨基酸的一般代 谢 氨基酸代谢库:外 源性氨基酸与内源 性氨基酸(1)转氨酶(除赖,苏,脯,羟脯氨酸外均可发生

12、转氨基作 用)谷丙转氨酶(GPT,ALT肝 中最高 谷草转氨酶(GOT,AST心中最 高 辅酶相同:为磷酸吡哆醛,磷酸吡哆胺互相转变(2)氨基酸的脱氨基作用L-谷氨酸通过L-谷氨酸脱氢酶(唯一既能利用NAD又能利用 NADP的酶)催化完成在肝,肾,脑中 ATP,GTP变构抑制 联合脱氨基作用-转氨基脱 氨基作用与L-谷氨酸脱氨基作 用偶联进行,把a-氨基酸转化 为a-酮酸及氨的过程 氨基酸通过嘌吟核甘酸代谢脱 去氨基一一心肌与骨骼肌中L-谷氨酸脱氢酶活性弱,主要靠 嘌吟核苷酸循环脱氨基 氨基酸通过氨基酸氧化酶脱去 氨基 在肝肾中存在,反应 中分子氧可直接氧化还原型的 黄素蛋白形成H2O2 过氧

13、 化氢酶广泛存在特别是肝(3)a-酮酸的代谢1,彻底 氧化分解供能,2、经氨基化生 成营养非必须氨基酸3、可转变 为糖和脂类 生酮氨基酸亮,赖 生糖兼生酮一一异,苯,酪,色,苏(1)体内氨的来源1、氨基酸 脱氨基与胺类分解2、肠道细 菌腐化3、肾小管上皮细胞 分泌的氨来自谷氨酰胺(2)氨的转运(1、丙氨酸葡 萄糖循环转运肌肉-肝 2、谷氨酰胺,氨从脑和肌肉运4.氨的代谢 往肝或肾 谷氨酰胺合成酶与谷氨酰胺酶(3)体内氨的去路(合成尿素)NH3个来游离一个来自天冬 氨酸 耗3ATP 尿素循环 1、氨基甲酰磷酸 的合成(CPS合成酶-I,N-乙酰 谷氨酸(AGA,Mg为辅酶,耗 能)2、鸟氨酸+C

14、PS瓜氨酸(线粒体)3、瓜氨酸+天冬氨酸精氨酸 代琥珀酸(精氨酸代琥珀酸合 成酶,耗能ATP消耗,Mg辅基)4、精氨酸代琥珀酸精氨酸+延胡索酸 5、精氨 酸尿素+鸟氨酸(精氨酸酶)(胞液)5.个别氨基酸的代(1)氨基酸的脱羧基作用(氨 谢 基酸在脱羧酶的作用下生成 胺,胺在单胺氧化酶作用下生 成醛,醛氧化生成羧酸)(2)一碳单位的概念、来源、载体和意义(在分解代谢过程 中生成的含一个碳原子的基 团,包括甲基,甲烯基,甲炔 基,甲酰基,亚甲氨基 四 氢叶酸是一碳单位的运载体 丝氨酸,色氨酸,组氨酸,甘 氨酸的分解代谢可产生一碳单 位 意义:参与嘌吟、嘧啶的 合成(四氢叶酸不足时可引起 巨幼细胞贫

15、血症)(3)甲硫氨酸循环甲硫氨酸+ATi S-腺苷甲硫氨酸+RHR S-腺苷同型半胱氨酸+H2O同 型半胱氨酸+氮甲基四氢叶酸(一碳单位的应用)宀甲硫氨 酸 甲硫氨酸为肌酸合成提供亚 基.(4)苯丙氨酸和酪氨酸代谢 氢生物蝶吟T四氢生物蝶吟(NADPH供氢)缺少苯丙氨酸羟化酶不能将苯 丙氨酸转化为酪氨酸,会经转 氨基生成大量苯丙酮酸,导致 苯丙酮尿症(PKU 酪氨酸 代谢另一途径为合成黑色素,酪氨酸酶缺乏可导致白化病(1)两条嘌吟核苷酸合成途径 的原料(从头合成:添一二 谷干”从头合成:1、IMP的生成(5 磷酸核糖经过PRPP合成酶ATP 消耗生成PRPP在酰胺转移酶 作用下生成5磷酸核糖胺

16、-PRA谷氨酰胺辅酶 经多步反 应生成IMP 2、IMP通过(腺 甘酸代琥珀酸合成酶,GTP-GDP天冬氨酸辅酶)生成 腺苷酸代琥珀酸 而后生成 AMP并放出延胡索酸 IMP通过(IMP脱氢酶,H20,NADi酶)生成XMP再在(Gl 合八、核苷 酸代 谢 1.核苷酸代谢 成酶,Gln,ATP-AMP作用下)生成GMP 补救合成:利用现成的嘌吟碱 或嘌吟核苷重新合成嘌吟核苷 酸 主要有APRT(腺嘌吟磷酸核糖 转移酶)与HGPR(次黄嘌吟-鸟嘌吟磷酸核糖转移酶)PRPI 为原料之一两种 HGPRT 缺乏可导致L-N综合征(自毁 容貌)核苷酸脱氧在二磷酸水平进行(核糖核苷酸还原酶,Mg离子)dN

17、DP+AT在激酶作用下生成 dNTP+ADP(2)嘌吟核苷酸的分解代谢产 物 先生成X(黄嘌吟)在黄嘌吟氧 化酶作用下生成尿酸(3)两条嘧啶核苷酸合成途径 的原料“谷氨酰 胺,C02天冬氨酸”从头合成:CPS-II(氨基甲酰 磷酸合成酶2,胞液ATP生成 ADF辅酶)经过一系列反应生成 OMFP乳清酸核苷酸),而后生 成UMP转化为UDP UDP(还原酶作用)可生成dUDP 而后生成dUMF在TMP合酶作用 下合成TMP UDP生成 UTP进一步生成CTP 补救合成:嘧啶+PRPP在嘧啶磷 酸核糖转移酶作用下生成磷酸 嘧啶核苷+PPi(4)嘧啶核苷酸的分解代谢产 物 胞嘧啶可生成乙酰COA进入

18、TAC(3-丙氨酸)胸腺嘧啶可生成琥珀酰COA进 入TAC或糖异生(3-氨基异 丁酸)嘧啶分解均可生成 CO2+N 在肝合成尿素 H3 2.核苷酸代谢的调 节(1)核苷酸合成途径的主要调 节酶(2)抗核苷酸代谢药物的生化 机制 主要为竞争性抑制干扰或阻断 核苷酸的合成,因此也有抗肿 瘤作用 6MP(6-巯基嘌吟)为主 九、遗传 信息 的传 递 1.遗传信息传递概 述 中心法则 DNA f RNA Pro 2.DNA的生物合成(1)DNA生物合成的概念(DN 以两条链各自作为模板dNTP为 原料进行解旋,复制的过程)(2)DNA勺复制(半保留,不连续,高保真,双向复制)需引物 DNApoll有5

19、-3的外切酶活性可 切引物,由单肽链组成,DNApolII无5-3外切酶活性,组成未知;DNApolIII无5-3夕卜 切酶活性,由多亚基不对称二 聚体组成(asG亚基组成核 心酶)复制辅助DnaA辨认起始点(上 游识别AT区串联重复序列,DnaB解链(下游结合反向重复 序列AT区),DnaC协助B,Dna(引物合成,SSB单链DNA吉合蛋 白,拓扑异构酶(gyrA,B)引 发体:含解旋酶,DnaC引物 酶(DnaG和DNA起始复制区 域的结构 真核生物DNApob起始引发引 物酶活性(无3-5外切酶活性),3低保真复制(无3-5外切酶 活性)丫线粒体DNA复制,8 主要酶(解旋酶活性),填

20、补引物空隙,切除修复重组 DNA复制中端粒解决染色体末 端复制问题,(3)逆转录(4)DNA勺损伤与修复(4种 修复)光修复(1)RNA生物合成的概念(2)转录体系的组成及转录过 程(无需引物)需要DDRP Mg,Mn离子 基 8识别,a决定被转录基 因,催化,结合模板2 asymmetric tran scripti on(不3.RNA的生物合成 RNAPol有a,核心酶+8为全 对称转录)模板链并非永远 在一条单链上(3)转录后加工过程(1)蛋白质生物合成的概念(2)蛋白质生物合成体系和遗 传密码(3)蛋白质生物合成与医学的 关系(1)基因表达的概念及基因表 达调控的意义(生物体表达出 合

21、适的蛋白质分子,以便更好 地适应环境,维持其生长和增 殖。)(2)基因表达的时空性(时间 特异性空间特异性)(3)基因的组成性表达、诱导 与阻遏管家基因的组成性表 达对外界刺激bu敏感;特 定环境信号刺激基因被激活,抑制,蛋白 质生 物合 成 蛋白质生物合成的 概述 基因 表达 调控 1.基因表达调控的概述 基因表达(gene expression)由基因生成具 有生物学功能产物(RNA 或蛋白质)的过程。一般包括基因转录及翻译的过程。基因表达调控(regulation of gene expression or gene control)生物体对基因 表达的多层次、多环节的调节。(4)基因表

22、达的多级调控原 核生物操纵子;真核生物 顺式作用元件(启动子、增 强子、沉默子),反式作用因子 启动序列(promoter)、操纵 序列(operator)(5)基因表达调控的基本要素 调节DNA序列和调节蛋白RN 聚合酶与启动子(1)原核基因表达调控(乳糖 操纵子-弱启动子)操纵子受阻遏蛋白的负性调 控、与O位点结合,6因子决 定识别特异性与RNAPO结合还 受CAMP-CA调控使活化G J 产物为多顺反子 mRNAchai n(2)真核基因表达调控(顺式 作用元件、反式作用因子)先利用的原因,Gf有 2.基因表达调控的 基本原理 (1)概念(可使细胞发生信号 应答的物质,多为激素类物质,能

23、调节靶细胞生命活动的化学 物质的总称,又称作第一信使)(2)分类 水溶性(肽类激素,生长因子)脂溶性(类 固醇,甲状腺激素)二、1.细胞信息物质 信息 物 质、受体 与信 号转 导 2.受体(1)受体分类和作用特点 膜受体,胞内受体(2)G蛋白 含有三亚基结构,其中a亚基主导可结合 ADP或 ATP 3.膜受体介导的信 号转导机制(1)蛋白激酶A通路G蛋白 偶联,CAM生成PKA作用:2R,2C亚基;使丝、苏氨酸磷 酸化 CAMP 应答原件CRE(P)作用:肾上腺素,胰高血糖素,促肾上腺皮质激素,甲状旁腺 激素 (2)蛋白激酶C通路 酪氨酸激酶的:RTK PI3K f IP3DAA PKC途径

24、 Liga nd 胰岛素,EGF,FGF G蛋白偶联的:PLS IP3DAG f PKC PLC 促 进PIP2分解生成PI3DAG PKC作用:丝苏氨酸激酶,可调 节细胞代谢,基因表达(3)酪氨酸蛋白激酶通路 RTQ Rasf MAPK途径 RTK f PLCf PI3DAGf C 途径 RTK f PI3K(SH)f PDK(PH f AktPKB 途径 Ras-MAPKKK Raf-MAPKK ERK-MAPK Grb2有 SH2 Domain SOS(富含脯氨酸)(4)非酪氨酸蛋白激酶通路 JAKs-STAT 途径 STAT(信 号转导子和转录激动子,sin gle tran sduc

25、tor and activators of tran slati on)非催化受体 用于IFN,IL-2,IL-3,EP(类固醇激素,维甲酸和甲状腺 素的作用机制(亲脂)维甲酸受体(RAR 类维甲 酸受体(RXR 激素反 应原件(HRE:反向重复,同 向重复与(单个位点-与孤儿受 体结合)半位点-6个核苷 酸糖皮质激素作用可翻译 出糖异生关键酶PEP羧激酶 甲状腺素分两类T3(三碘甲腺 原氨酸),T4(甲状腺素)作 用方式 两类1:血循环到靶 细胞入胞核调节基因发生生理 效应(细胞生长,组织发育)2:与线粒体内膜R结合作用线 粒体mRNA加强氧化磷酸化 4.胞内受体介导的 信号转导机制 LDL

26、受体缺乏与高胆固醇血症 有关 抗乙酰胆碱受体抗体为重症肌 无力病因(1)重组DNA技术相关的概念(2)基因工程的基本原理(分,切,接,转,筛)(1)疾病相关基因的发现(2)生物制药(3)基因诊断(4)基因治疗(5)遗传病的防治 1.血液的化学成分(1)水和无机盐 四、癌基 因与 抑癌 基因 1.癌基因与抑癌基 因 2.生长因子(1)癌基因的概念(2)抑癌基因的概念(1)生长因子的概念(2)生长因子的作用机制 五、(2)血浆蛋白质(肝)除 1.重组DNA技术的概 述 重组 DNA2.基因工程与医学 技术 血液 生化 占人 体体 重 7-8%2.血浆蛋白质 全血 二血 浆+有 形 成分 血浆 二全

27、 有形 成分 血清 二全 有形 3.红细胞的代谢 清蛋白外均为糖蛋白(3)非蛋白质含氮物质(NPN 尿素,尿酸,肌酸,肌酐,氨,氨基酸,多肽和胆红素等(4)不合氮的有机化合物(1)血浆蛋白质的分类(2)血浆蛋白质的来源(3)血浆蛋白质的功能(1)血红素合成的原料、部位 和关键酶(2)成熟红细胞的代谢特点 成分-纤 维蛋 白原 、八、肝胆 生化 1.肝脏的生物转化 作用(1)肝脏生物转化的概念和特 占 八、(2)生物转化的反应类型及酶 系(3)影响肝脏生物转化作用的 因素 2.胆汁酸代谢(1)胆汁酸的化学(2)胆汁酸的代谢(3)胆汁酸代谢的调节 3.胆色素代谢(1)游离胆红素和结合胆红素 的性质

28、(2)胆色素的肠肝循环 维 生 素 本质 活性形式 辅酶 作用 缺乏病 A 视黄 视黄醇/醛/酸 视觉、上夜 勺盲 耳症、醇 皮 干眼病 D 类固 1 25-2(OH)-VitD3 调节钙、佝偻病、醇 磷代谢 1 T l-S/r-J、E 生育酚 抗氧化、生育 K 促进凝血 易出血 B1 硫胺 素 TPP 竣 脱酶 脱羧、抑 制胆碱脂 酶 脚气病、末梢神 经炎 B2 核黄 素 FMN FAD 脱氢 酶 生物氧化 口角炎、唇舌炎 PP 尼克 酸/尼 克酰 胺 NAD NDAP 脱氢 酶 生物氧化 癞皮病 B6 吡哆 醇/醛/胺 磷酸吡哆醛/胺 氨 转酶 氨基酸代 谢 叶 酸 FH4 一碳单位 转运 巨幼红 细胞贫 血 B12 胺 钻素 甲基转 移、DN 巨幼红 A田胞贫 合成 血 C 抗坏血酸 坏血病

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