NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦.pdf

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1、NCBI PubMedNCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦检索简介与检索技巧集锦注：在本文中的叙述中，所有输入 PubMED 检索框中的内容均用符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为。PubMed 简介PubMed 是由隶属于美国国家卫生部（NIH,National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM,Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI,National Center forBiotechnology Information）提供，可通过NCBI 网站的 Entrez 检

2、索系统（Entrez retrieval system）进行 MEDLINE 和 PreMEDLINE 引文数据库的在线免费检索。此外，PubMed 还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归 NCBI 所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D 蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。Entrez 检索系统是 NCBI 在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索 NCBI 网站的主要数据库，如 PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM 等

3、等。PubMed 是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的 NCBI 提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM 入口等，以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给 NCBI。如果该出版商有网站，则 NCBI 会提供相应的网络出口。MEDLINE及 PubMed 引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。PubMed 服务内容概括基于互联网 WWW 的 MEDLINE 及 PreMEDLINE 引文数据库免费检索系统。提供 MEDLINE、PreMEDLINE 与其他相关数据库接入服务，如 NCBI

4、的其它数据库 DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D 蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，及 NCBI 外的其它数据库。提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界 70 多个国家和地区的 4000 余种生物医学期刊，现有书目文摘条目 1000 万余条，时间起自 1966 年。随着国内互联网的普及，网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展，了解世界先进水平的一个重要手段。传统的医学文

5、献检索（MEDLINE）尽管在本地局域网提供的情况下，具有高速的特点。但与互联网所提供的免费 MEDLINE 检索无法相比。网上免费 MEDLINE 检索的主要优势包括：更新速度快，能最快地了解世界各地的研究进展。PubMed 与 MEDLINE 的异同MEDLINE 是 NLM 最重要的索引期刊引文数据库和摘要（indexed journal citations），内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学，其内容已覆盖了美国及其它 70 多个国家和地区的 4,500 余种期刊。MEDLINE 所提供的引文索引内容是世界范围内的，但其中大部分为英语语种期刊，或者是有英文摘要

6、的期刊。MEDLINE 检索内容可起始于 1966 年，引文条目已超过一千万条，但MEDLINE 所提供的在线检索内容只起始于 1976 年，而早于60 年代中期（1966）的引文条目，则可在 NLM 所提供的 OLDMEDLINE 服务在线检索。所有在 MEDLINE 数据库中的文献均已加上了主题词和发表类型。MEDLINE 数据库内容是 NLM PubMed 的最主要检索内容。PubMed 除了 MEDLINE 数据库的内容外，还包括：与 MEDLINE 生命科学有关的其它研究领域（如天文技术）的文献资料在期刊内容还未列入 MEDLINE 之前的文献资料一些递交了全文到 PubMed 中心

7、（PubMedCentral），并经NLM 评述了的其它生命科学期刊文献资料由上可见，通过 PubMed 检索的医学文献资料比单纯地检索 MEDLINE 所获得的信息内容更多，更广泛，可检索到与生命科学有关的其它学科（如天文技术）在生命科学的应用。当然，如果检索者需要特定地检索 MEDLINE 数据库内容，可在检索页面点击“Limit”并从“Subsets”中选择 MEDLINE，可达到对 MEDLINE 数据库的专一限制性检索。关于 PubMed 与 MEDLINE 的具体异同，读者也可参阅 NLM 提供的在线资料（见后附录）。PreMEDLINE 是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断

8、地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向 MEDLINE 移加一次。自动术语匹配自动术语匹配（automatic term mapping）是指 PubMed 对输入检索框中的检索词进行智能化地校地，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则，依次为主题词表（MeSH(Medical SubjectHeadings)Translation Table），期刊表（Journals Translation Table），短词表（prase List），作者索引（Author Index）。2.期刊匹配表（Journal Translation Table）该表

9、包含了期刊的全名（Full name of journals），MEDLINE 期刊缩写（MEDLINE abbreviations），以及期刊的 ISSN 号（ISSN numbers for journals）。作用在于将检索框中的检索词自动地与期刊名称匹配，如检索，PubMed 会自动地将其翻译为。3.短词表（Phrase List）短词表源自 MeSH，UMLS 和 Supplementary Concept Substance Names，如。4.作者索引（Author Index）如果以上均未找到匹配项，且在检索词后还有一个或两个字母，PubMed 将会自动地进行作者名称匹配。都不

10、行？PubMed 将短语打散后，再进行匹配，直到有匹配项为止。若还找不到，则将单个术语用 进行组合，在所有检索标签中查找自由词检索特点自由词检索即指在对检索词无任何（检索标签）修饰的情况下进行文献检索，如欲检索“小儿哮喘药物治疗”，只需在 PubMed 提供的检索框中输入即可，PubMed会自动地根据“术语自动匹配”（automatic term mapping）原则智能化地在可能有关联的检索词之间匹配一个布尔什操作符号（Boolean operators）AND。最常用的检索条目最常用的检索条目包括作者作者检索格式：。如检索“smith ja”或“jones k”。以此格式进行名字的检索，P

11、ubMed 会自动地将其识别为作者名（author field）检索。如果只输入“名（last name）”1）将作者姓名用双引号，并加上检索标签（search tag）读懂 PubMed 网页内容在检索文献时，如果检索者比较细心的话，会发现每一个检索条目中，在 PMID 后，会标记下述三个标签之一。这三个标签是什么意思呢且看下面的详细解释。PubMed-indexed for MEDLINE：已经加入的 MeSH，发表类型，GenBank 索取号及其它可索引数据资料的文献PubMed-in process：已递交到 PubMed 数据库，但尚未加入 MeSH 等索引数据资料的文献PubMed

12、-as supplied by publisher：特指由出版商提供的，未加入 MEDLINE 数据库的文献从上面，又可再次的窥探 PubMed 与 MEDLINE 的异同，以及为何检索 PubMed 时，会比仅检索MEDLINE 的文献条目要多！日期及日期范围限定格式：（即：年/月/日 小时:分钟，且年、月、日、小时、分钟的数字位数必须写足其标准格式，即分别为 4、2、2、2、2 位数，当不足两位数时，补上数字零，如。上述格式中，除“年”外，其它均是可选项，如、等。日期范围限定检索格式：，即两个日期之间用冒号隔开，且两个时间段之间可精确到分钟，冒号与两个具体日期之间是否有空格并不影响检索结果

13、。数字位数规则与前相同。如、等。Limiting by Date（日期限定）使用Entrez 下拉式菜单，可以把你的搜索范围设定在30 天到 10 年，出版日期下拉菜单有 Publication Date 与 Entrez Date 两项，以确定使用那种日期记法来设定搜索范围。使用 From、To 框输入一个时间段；以 YYYY/MM/DD 的格式输入日期（月和日可不填）常用的检索标签AB(Abstact)：文献摘要AD(Affiliation)：第一作者的研究单位与地址，及资助号AU(Author)：作者CY(Contry)：期刊发表的国家DP(Puclicaiton Date)：文献发表的

14、日期EDAT(Entrez Date)：文献录入 PubMed 的日期FAU(Full Author Name)：所有作者的名字IP(Issue)：期刊的期号LA(Language)：文献发表的语言类别MH(MeSH Terms)：NLM 文献数据库中的医学主题词MHDA(MeSH Date)：MeSH 加入文献的日期。当医学主题词加入文献后，该日期才与 EDAT 日期一致PMID(PubMed Unique Identifier)：每条 PubMed 文献的唯一识别符PT(Publication Type)：文献发表的类型，如综述，病例报道等PG Pagination The full pa

15、gination of the articleRF(Number of References)：特指综述（Review）类文献所引用参考文献的数目SB(Subset)：副主题词TA(Journal Title Abbreviation)：期刊名标准缩写TI(Title)：文献标题UI(MEDLINE Unique Identifier)：MEDLINE 文献唯一识别符VI(Volume)：期刊的卷号检索技巧及注意事项小集锦1.输入布尔什操作符（包括 AND，OR，NOT），所有字母必须大写。当输入多个布尔氏操作符时，其处理的顺序为从左到右。如欲改变此顺序，则可用括号将需要组合的检索式括起来组成

16、一个相对独立的检索项，如。加上括号后，PubMed 会优先检索括号中的内容，然后再将其内容与括号外的检索内容进行相应的组合，以得到检索者所需要的特定检索策略结果。2.不区分检索词的大小写，即检索“DNA”与“dna”是一样的。3.在对一些特定内容（如作者名，期刊名）进行检索时，应当养成用双引号将其括起来的习惯。因为，在无双引号将这些特定内容括起来，以告诉PubMeD 搜索引擎“这是一个特定的检索词”的情况下，PubMed 将自动地按照“术语自动匹配”原则对检索词识别后再检索，如当检索的期刊名为“Gene Therapy,Science,Cell”时，PubMed 会自动地将其标记为 MESH

17、后再检索，而不是按照期刊名来检索。为了避免这种情况发生，检索式应当为，或。4.利用通配符进行检索。在一个单词之后加上该通配符后，PubMed 可检索以通配符前字母开头的至少 150 种相应单词，但，当使用这一功能时，就不能其“术语自动匹配”功能了。如可检索到“flavor,flavored,flavorful,flavoring”等。5.进行特定短语搜索时，可用双引号将其括起来，不过，此时也同样丧失了“术语自动匹配”功能。6.对于特定内容的检索，如阅读一篇原文时，想对其后的某一篇参与文献检索。此时，如果用常规的 PubMed 检索策略就比较困难和哆嗦一点。不过，通过PubMed 所提供的特殊检

18、索功能，可达到此目的-单一文献匹配检索器（Single Citation Matcher）和批量文献匹配检索器（Batch CitationMatcher）。顾名思义，前者可以特定的条件（如期刊名、文献的卷号、发表日期、文献首页页码等）快速地找到所需文献；而后者，则对同一批文献进行检索，如检索 Science 期刊 2002 年第一期杂志。上述两上功能模块均可在 PubMed 检索页面的左侧导航栏中找到相应的连接标签。此外，还可通过 EMAIL 方式特定地查找文献资料（，在信的正文只输入“help”可获得应用该功能的帮助信息资料文件）。7.当使用检索标签（search tags）限定检索词属性

19、时，检索标签应用方括号括起来，且对检索标签字母大小写不敏感（不影响检索结果），且检索标签与检索词之间是否有空格亦不敏感（不影响检索结果）。推荐参考读物PubMed 概况简介URL：PubMed 提供了的官方在线帮助文件详细介绍了如何应用它来进行文献检索，以及检索中的技巧与注意事项问题。本文中的大部分内容均源于此帮助文件。URL：PubMed 提供的在线 FAQ 文件URL：NCBI PubMedNCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦（二）检索简介与检索技巧集锦（二）近年来，随着 INTERNET 的普及，一些机构通过 INTERNET 提供 MEDLINE 数据库免费检索服务，如美国国

20、立卫生院提供的 PubMed 检索系统)、由广告商提供的HEALTHGATE检索系统)和 MEDSCAPE 检索系统、HELIX 检索系统、MEDEC 检索系统等、AVICENNA 检索系统等。其中PubMed 数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。但由于不少使用者不熟悉 PubMed 的使用方法，因而不用或少用，即便使用，检索结果也不太满意。本文拟简要介绍 PubMed 及其具体操作方法。PubMed 检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于 MEDLINE 和 PREMEDLINE。其中 PREMEDLINE 是指将要进入 MEDLINE 数据库的文献先做成

21、一个数据库，数据为每天更新。PubMed 提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。1.1.主题检索主题检索在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击 search按钮，PubMed 就会利用自动词语匹配功能将重要的词或词组用AND组合在一起进行检索。当然，也可使用 MeSH/副主题词组配格式(MeSH 为 Medical Subject Headings 的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如 neoplasms/diet therapymh*。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检

22、索词根据 MeSH 注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。MeSH注释表MeSH 注释表包括 MeSH 词、副主题词、MeSH 词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH 词和自由词(即 textword)同时进行检索。例如，如果我们输入 Vitamin h,PubMed 会这样检索：(“BiotinMeSHOR itaminhtw)-vitamin h 是 MeSH 词 Biotin 的款目词。期刊名注释表包括期刊名全称、期刊名 MEDLINE 缩写、ISSN 号。例如，如果你输入“New Englan

23、dJournal of Medicine”，PubMed 将按“N Engl J Medta”查询。常用词组表如果在 MeSH 注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED 就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如 cold compresses。作者索引如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed 就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed 就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed 将该词组的每个单词用AND组配并在所有字段中查找。2.2.作者姓名检索作者姓名检索输入作者姓名时应采用

24、姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如 SmithJA。PubMed 将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed 会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入 Yang,则 PubMed将象下面一样检索：Yin-Yangmh或 Yangtw。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符au 限制，如“smith j”au，PubMed 将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。3.3.期刊名称检索期刊名称检索可以输入期刊名全称检索，如 molecular biology of th

25、e cell;期刊名 MEDLINE 缩写名称检索，如 mol biol cell;或 ISSN 号检索，如 1059-1524。如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed 会将其当作 MeSH 词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识ta，如 genetherapyta。如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如 scanningta，否则会在所有字段检索该词。推荐使用期刊名称全称或 MEDLINE 缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN 号是不能保证的。4.4.截

26、词检索截词检索在词的末尾加*号，PubMed 就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括 infections，但不包括 infection control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart attack*不会匹 配 MeSH 词，也 不 会 扩 展 检 索 my-ocardial infarction、myocardial stunning、shock,cardiogenic 这些方面的文献。5.5.词组检索词组检索(规定规定 PubMedPubMed 检索一个词组检索一个词组)如

27、果 PubMed 检索在常用词组列表中已有的词组，如 poi-son ivy,PubMed 就会把它作为一个词组来检索。但有时 Pubmed 可能找不到相应的词组，如 brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得 PubMed 将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定 PubMed 进行词组检索，PubMed 就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。6.6.每页显示的文献数量每页显示的文献数量PubMed 将检索出的文献记录按每页 20 条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击numberof documents to display perpage下拉菜单，并

28、选择一个更大的值。7.7.检索时间范围限制检索时间范围限制使用entrez date limit下拉菜单可限制检索时间范围。entrez date是引文追加到PubMed 数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。8.8.检出文献记录显示格式检出文献记录显示格式使用“abstract report”(PubMed 缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed 和 MEDLINE 登记号等。引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有

29、)、出版类型、MeSH 词、资助号、PubMed 和 MEDLINE 登记号等。MEDLINE 报告：MEDLINE 记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。9.PubMed9.PubMed 检索规则与语法检索规则与语法布尔运算符 AND，OR，NOT 必须大写，例如，vitaminc OR zinc；PubMed 从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。指定文献记录字段名称检索，如 dnamhANDcrickauand1993dp。下面列出常用字段名称缩写：DP-出版日期采用 YYYY/MM/DDDP格式，

30、如1998/03/06DP。输入日期范围则用冒号连接，如 1996：1998DP，1998/01：1998/04dpAD-第一作者机构名称、地址、资助号如 LM05545/LM/NLMadAU-作者姓名如 obrienjauTA-期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchemta或 0021-9258taLA-文献出版语言ChineselaMH-Mesh 主题词neoplasmsmh或 neoplasms/dtmhPT-出版类型reviewptTW-自由词AA001794twT1-文献标题内自由词 leiomyosarcomati经常通过单击 Details 按钮观察 PubMed

31、 怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。10.PubMed 在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文。PubMedPubMed使用手册使用手册（一）PubMed简介：1.PubMed 是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于 WWW 的查询系统。2.PubMed 是 NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。3.PubMed 是提供免费的 MEDLINE、PREMEDLINE 与其他相关数据库接入服务，MEDLINE 是一个拥有 1 亿字条的巨大数据

32、库。4.PubMed 也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物 学数据，序列中心的数据等等。5.PubMed 提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归 NCBI 所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D 蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。（二）页面介绍:并单击回车键后，你将进入 Pubmed 的主页面。如图：主页面左侧框的介绍MeSh Browser 你可以用它来分层流览 MesH 表 Single Citation Matcher 通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。Batch Citution Matcher 用一

33、种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4 个范围：治疗、诊断、病原学与预后。Old PubMed(使用以前的 PubMed 查询方式)关于每一项的具体使用方法,后面将会有详细介绍。3)Related Resources Order Documents提供一种收费性质服务，可以使用户在当地得到文献的全文拷贝（费用与发送方式各不相同）。Grateful Med是对另一个 NLM 基于网络的查询系统的链接。Grateful Med 也提供MEDLINE 的接入，并且还有一些其他的数据库如 AIDSLINE、

34、HISTLINE 等等。Consumer Health提供与 MEDLINEplus 的链接，MEDLINEplus 是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。Clinical Alerts 此部分的目的是加快 NIH 资助的临床研究成果的发布。2.主页面底部的介绍Diclaimer 在这里可以得到版权的相关信息，不承诺责任与担保的声明，与 NLM 下载的相关政策。Write to the Help Desk 发 e-mail 给 NLM 消费者服务部。NCBI|NLM|NIH 这里是对创建和维护 PubMed 的机构网页链接。3.下面将举例说明查询的主体部分，也就是页面上部的使用方法

35、。假如我们这次的工作是查找与 gallstone、pain 有关的文献。1.在对话框中输入查询词。比如我们这次输入的是 gallstone pain，然后单击“go”按钮或按回车键，PubMed 将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。你可以随时向查询框输入查询词，点击“go”按钮开始新的查询。“clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容，然后开始一个新的查询。在查询框前 search 提示后有一个下拉式菜单，你可以在这里选择其他的信息资源或NCBI 的数据库。o Structure 搜索分子结构数据库(MMDB)The Molecular Modeling Database，这个

36、数据库保存的是由 X 线晶体成像、NMR 分光光度法建立的三维分子结构。o Genome 提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。o PopSet 这个数据库中的内容是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。1.下面我们将详细介绍查询结果屏幕。1.显示选项（Display Option）在 Display 后面有一个下拉式菜单，在这里可以选择各种显示选项。简要格式（Summary）在缺省设置下PubMed 采用这种显示格式，他所显示的内容包括以下几项：作者：纪录中的所有作者都奖杯显示出来。相关：列出相关内容，如文章

37、、蛋白质、核苷酸等（列出的文章不以摘要格式显示）。文章题目：英语以外的语种的题目将被翻译成英语，并且加上括号。来源：提供文献所在期刊名的缩写，出版时间，卷，页数，也包括语种（针对非英语文献），出版类型。没有摘要的文献将显示“No abstract avilaible”标识数字：提供 PubMed 标示（PMID）与 MEDLINE 唯一标识（UI）。简报格式（Brief）显示的条目内容包括作者姓名、文献名的前 10 个字母、PubMed唯一标识。摘要格式（Abstract）将会显示以下几项内容：文献题目、作者、第一作者单位（地址）、期刊来源（期刊名简写、出版日期、卷、页数）、如果必要加上标注、

38、出版类型、非英语文章加上标注、摘要、备注、PubMed 与 MEDLINE 的唯一标识。图例格式（Legend）：显示文献出处、名称、作者、第一作者单位（地址）、摘要、PubMed 与 MEDLINE 的唯一标识。引证格式（Citation）提供如下信息：文献出处、文献题目、作者、第一作者单位（地址）、如果必要加上标注、出版类型、摘要、红体显示题目中的错误字串、备注、MeSH词、人名作为主题、（如果存在）化学物质、（如果存在）巨大数字、PubMed 与 MEDLINE的唯一标识。MEDLINE 格式（MEDLINE）用两字符的形式显示 MEDLINE 纪录中所有的内容，使用这种格式可以把记录下

39、载到管理书目的软件程序。2.查询概要（Retrieval Summary）查询概要显示了查到所有条目的数量，以及需要多少页来显示，缺省情况下 20 条/页。Show 后的下拉式菜单可以选择相应得每页显示的条目数。Page 选择页数，PubMed 根据你的选择而显示不同页的内容，所选中的页数以红色显示，单击 或 显示其他页码。详细内容（Details）单击 Details 按钮可以显示你正在进行的查询方案，包括查询词、MeSH 表映射与 PubMed 词语索引的映射；错误信息，比如禁用词、截断警告、错误拼写等；在编辑框中可以编辑一个新的查询方案，然后重新提交；在这里还可以保存查询方案。o 你可以

40、在 Details 的对话框中修改查询方案，然后点击“Search”按钮进行新的查询。o Result 下的数字是查询结果，并且可以链接到现今的查询结果。PubMed 实际上是一个更大数据库 PubRef 的子集，PubMed 的查询一般不包括 PubRef 中的条目，除非你在编辑框中将“AND notpubrefsb”删除。o 在 Details 中保存一个查询方案：单击 URL 按钮，PubMed 将返回到查询结果窗口，经过修改的查询方案将显示在对话框中，并且查询方案也被嵌入 URL 中，然后使用你的浏览器的书签功能将现在的 URL 保存成一个书签，保存后，可以编辑书签功能将此书签改为比较

41、容易记忆的名字，使用方法与其他的书签相同。o 定期查找功能 如果你想每隔一段时间进行一次同样的查询，以找到最新的文献，可以这样作：第一步如保存查询方案，通过选择书签的方式重新运行查询方案，然后，在Limit 中的 Entrezdate 下拉菜单将时间限定在搜索范围。加入剪切板（Add to clipboard）剪切板可以帮你保存察看你在一个或多个查询里所查到的内容；剪切板中最大的保存数目是 500 条；如果你连续在 PubMed 或其他 Enterz 数据库中不进行任何操作达 1 小时，剪切板中的内容将会消失。要将条目加入剪切板，先将所需要的条目前的复选框选中，然后单击“Add to clip

42、board”按钮，一旦你将一条内容加入剪切板，纪录数字的颜色将会改变。保存（Save）功能是保存查询到的条目。如须保存所有的查询结果，先在 Display 下的下拉菜单中选择所需显示格式，单级“Save”按钮。如果要保存特定的条目，现在条目前的复选框选中，点击“Save”按钮。最大的保存的数量是 5000，如果你想保存超过这个书目的内容，PubMed 将显示一条提示你修改查询的信息。文本（Text）使用文本功能可以将条目以纯文本的方式重新显示，把那些 Web与 HTML的内容去除，当看完纯文本的内容后，按浏览器的“Back”回到以前的 Web 页面。你可以使用此功能将 PubMed 侧框与按钮

43、除掉，在用打印机打印。纯文本版本将会显示你所选中的条目的内容，如果没有选中任何条目，所有的条目内容都江北显示出来。定购（Order）通过一些中间商得到文献的全文。练习题：1.找出与 Shingles、facial paralysis 有关的文献，用包括摘要与 MeSH 词的方式显示。2.找出与 hypertension nosebleed 有关的文献，在一页中显示所有查到的结果。参考答案（可能会有不同）特征栏特征栏可以选择一些其他的功能Limit 单击特征栏上的 Limit 显示 Limit 页，这里你可以设定：o 将搜索范围设定在一个特定的域。o 将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或

44、动物学范围。o 也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型（如综述）。o 设定只搜索包含摘要的文献。o 设定搜索 Entrez 数据库或 Publication 数据库。o 设定搜索范围为 PubMed 数据库的某一子数据库（如 Abridged Index Medicus 或AIDS 相关的条目）。下面将逐一进行介绍：Field Selection（域选择）你可以把搜索词限定在一个特定的域，缺省设置是所有的域；打开下拉菜单选择你所需的域名。Only items with abstract（只搜索包含摘要的条目）如果将这个复选框选中，将只搜索包含摘要的文献。Publication T

45、ype（出版类型）其后的下拉菜单是常用的出版类型列表。Language（语言）将近 40 种语言列在此菜单里，都是在搜索时经常用到的。Age（年龄）选择人类学研究的年龄组。Gender（性别）在此下拉菜单选择人类学研究的性别组。Human or Animal（人类或动物）在此下拉菜单选择研究对象。Subset（子集）你可以将自己的搜索限制在下列 4 个组中的一个。o 条目处理阶段Publisher：出版商发送来的原样PreMEDLINE：正要往 MEDLINE 中加入的纪录MEDLINE：所有 MeSH 表索引的纪录o 主题词过滤AIDS：NLM Saids 数据库o 期刊组AIM：Abrid

46、ged Index Medicus（120 种英文期刊）Dental：牙医学期看的子集Nursing：护理学期刊的子集o PubRef：这是一项将搜索词范围扩大的服务，选择此项将会搜索更广范围的科学期刊（如物理、天文等）而不是限定在PubMed 中，这个选项也可以帮用户搜索到出版商网址上的文献全文。Date(日期)PubMed 中包括自 1966 年来出版的文献，新条目周二到周四加入。在PubMed中有两种日期表示方式：Entrez日期是条目最初被加入PubMed的日期，Publication（出版）日期是文献出版时的日期。PubMed 已 Entrez 日期顺序来显示你的查询结果的，最新被加

47、入的纪录第一个被显示出来。Limiting by Date（日期限定）使用 Entrez 下拉式菜单，可以把你的搜索范围设定在30 天到 10 年，出版日期下拉菜单有 Publication Date 与 Entrez Date 两项，以确定使用那种日期记法来设定搜索范围。使用From、To 框输入一个时间段；以 YYYY/MM/DD 的格式输入日期（月和日可不填）Limit Indicator Limit 旁边的复选框如果处于选中状态则表示限定条件生效，如果开始搜索，生效的限定条件将会以黄色框 Display 按钮的上面。注意再进行其他搜索前将 Limit前的复选框去掉，以消除限定条件。Pr

48、eview/Index（预览/索引）使用特征栏的 Preview/Index 可以做到：o 在显示条目之前显示所查到的文献数。o 随时通过增加查询单词来修改查询方案。o 在特定的搜索域中向方案里加入查询词。o 从 Index 中查看并选择词语来修改查询方案。o 在你修改查询时查看方案。下面将详细加以介绍：Preview(预览)使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。在输入框中键入搜索词，然后单击 Preview，PubMed 返回的信息是条目的数量。通过增加一个或多个单词来修改查询方案。向查询框中加入另一个词语点击 Preview，你可以继续向框中加入多个词语，点击 Preview 直

49、到你希望得到的内容,当修改查询时可以看到搜索方案与查询结果的数量。Preview 显示的是历史记录中最近的三条记录，使用History 可以看到最近 100 次的查询结果。History 中的 Clear History 按纽也可以清除Preview/Index 中的内容。向下滚动 Preview/Index 找到“Add to Query or View Index”部分，使用下拉菜单确定一个搜索域，向文本框中加入词语，单击 Preview，向查询框中加入词语并且可以看到查询结果。现在我们向查询框中加入 MeSH 词 Nurse，使用下拉菜单确定一个搜索域，向文本框中填加一个词，单击 Pre

50、view，你可以一直这样加入单词，单击 Preview，直到完成你的搜索方案。Preriew 自动使用“AND”运算符来将单词合为一体，即要求同时查询包含两个词的文献。使用布尔运算符按纽。使用布尔运算符将你要查找的词语连接起来，OR 代表的是要查找的文献包括第一个搜索词或第二个词，NOT 为“否”，包括第一个搜索词而不包括第二个词的文献。每加入一个搜索词都要点击 Preview 来列出搜索结果的数量。查询举例让我们查找一下有关碳水化合物(Carbohydrate)或大豆(Soybeans)对骨质疏松症影响的文献。使用下拉菜单确定一个搜索域，向文本框中加入一个词语，单击 AND 按纽，我们可以预