生物资讯研习会.pdf

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1、生物資訊研習會 時間：97 年 9 月 12 日 星期五 AM 10:00-PM 12:30 地點：立夫教學大樓 2 樓 201 講堂 講者：許宏吉 經理(源資國際生物科技股份有限公司)內容：MetaCore 1.內含 500 個以上經人工校正過之訊息傳導圖。2.不同類型資料可以同步呈現在訊息傳導圖上，並可以圖形檔格式輸出 3.可輸入 miRNA 數據資料進行訊息傳導分析 4.提供各種物種，組織與分析方式的篩選功能 5.包含 GO 與 GENEGO GO 基因屬性分類統計方法 6.實驗數據比較分析流程功能一次可以進行交叉比對，訊息傳導圖分佈，GO 基因屬性分佈，GeneGO 基因屬性分佈，疾病

2、分類分佈與訊息傳導網路分佈，並直接輸出結果報告 ACD/Labs 1.唯一提供整合所有光譜的軟體 2.可讀取各家光譜儀器廠商的檔案 3.可以提供快速建立報告的功能 4.可建立專屬的光譜資料庫 5.可針對光譜資料來進行資料搜尋的功能 6.有全世界最完整的 NMR 資料庫 Tripos SYBYL 1.該軟體可以安裝在 RedHat Enterprise Linux 5的作業系統 2.有支援多 CPUs 的運算處理 3.在化學小分子處理方面，3D QSAR CoMFA 及 Topomer 等技術皆為 Tripos 公司的專利 4.該軟體有提供高速篩選蛋白質與化學小分子之間交互作用力的預測 5.提供

3、專屬的蛋白質結構資料庫 6.有專為小分子設計的資料庫搜尋引擎 7.所已有功能皆在同一視窗下進行計算 8.可讀取大量資料進入系統 CLC Bio combine workbench 1.整合各個序列分析功能為一體的系統性軟體 2.接受目前大部分軟體分析結果格式的系統 3.目前唯一含有 RNA 二級結構預測功能的軟體 4.提供與國外 NCBI 資料庫連結的搜尋工具 5.以 Cluster W 為運算模式的序列排序分析方法 CLC cube 1.以具有專利權的特殊晶片為運算模組加速器 2.相當於 20 顆 CPU 的伺服器運算速度 3.提供以 Smith-Waterman 為運算方法的 BLAST 4.可以跨平台接受 Windows 與 Linux 平台運算 Mutation surveyor Genemarkers 此軟體運用於分析 DNA 序列的功能相當齊全，其中包含傳統至換突變外，還可以運用於偵測置入性（Insertion）與剔除性（Deletion）位置偵測。除此之外，針對單點核酸多態性（SNP）偵測率先採用訊號積分法來絕對偵測訊號比例，有效提升數據判讀的準確性。截至目前為止，在國際上的參考文獻中，有超過 50 篇以上的文獻皆是使用此軟體分析的數據所投稿的文章。所以這是在研究工作上不可或缺的工具