核苷酸和或氨基酸序列表和序列表和序列表电子文件标准-核苷davg.docx

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1、ZC中华人民民共和国国知识产产权行业业标准ZC 000033-20001核苷酸和和/或氨氨基酸序序列表和和序列表表和序列表表电子文文件标准准20011-11-01发布布 20002-11-01施行行 中华华人民共共和国国国家知识识产权局局 发发 布前言核苷酸酸和/或氨基基酸序列列表和序序列表电电子文件件标准是是中华人人民共和和国知识识产权行行业标准准之一,编编号为ZZC 000033-20003。本标准的的附录11为规范范性附录录,附录录2为资资料性附附录。本标准由由中华人人民共和和国国家家知识产产权局提提出并归归口。本标准由由中华人人民共和和国国家家知识产产权局标标准化委委员会批批准。本标准

2、起起草单位位:中华华人民共共和国国国家知识识产权局局核苷酸酸和/或氨基基酸序列列表和序序列表电电子文件件标准制制定工作作组。本标准主主要起草草人:黄黄庆、宁宁珑、翟翟薇、潘潘爱群、孙孙广秀、张张宇、鲁鲁红梅、叶叶大伟、方方克、常常矛、王王朋飞、魏魏春宝核苷酸和和/或氨基基酸序列列表和序序列表电电子文件件标准1 总则则根据专利利法实施施细则第第18条第第4款的规规定,包包含一个个或多个个核苷酸酸或者氨氨基酸序序列的发发明专利利申请,说说明书中中应当包包括符合合国家知知识产权权局专利利局规定定的序列列表,并并按照国国家知识识产权局局专利局局的规定定提交含含有该序序列表的的计算机机可读形形式的副副本

3、。为了使提提交的纸纸件形式式的核苷苷酸和/或氨基基酸序列列表及计计算机可可读形式式的含有有该序列列表的电电子文件件规范化化,以利利于申请请人提交交;也为为了使序序列表电电子文件件可以快快捷地输输入国家家知识产产权局专专利局的的计算机机数据库库,并与与其它的的序列检检索数据据库交换换数据,以以利于公公众检索索;同时时也利于于专利局局审查员员加快审审查,更更好地为为申请人人服务;特制定定本标准准。2 适用用范围本标准适适用于所所有向国国家知识识产权局局专利局局提交的的包含核核苷酸和和/或氨基基酸序列列的发明明专利申申请,具具体地说说,适用用于该申申请提交交的纸件件形式的的核苷酸酸和/或氨基基酸序列

4、列表,以以及含有有核苷酸酸和/或氨基基酸序列列表的计计算机可可读形式式的序列列表电子子文件。3 术语语和定义义在本标准准中,采采用下面面术语和和定义:(1)序序列表:是指以以纸件形形式提交交的专利利申请说说明书的的一部分分,它公公开了核核苷酸和和/或氨基基酸序列列的详细细内容和和其它有有用信息息。序列列表中的的序列是是不少于于10个核核苷酸的的非支链链核苷酸酸序列,或或者是不不少于44个氨基基酸的非非支链氨氨基酸序序列。所所述的序序列不包包括支链链序列;不包括括具有少少于4个特别别定义的的核苷酸酸或氨基基酸的序序列;也也不包括括含有列列于附录录1之表14以外的的核苷酸酸或氨基基酸的序序列。(2

5、)序序列表电电子文件件:是指指包含核核苷酸和和/或氨基基酸序列列表的计计算机可可读形式式的纯文文本文件件。(3)核核苷酸:只包括括附录11之表1中列出出的符号号所表示示的核苷苷酸。附附录1之表2中列出出的符号号用于表表述核苷苷酸的修修饰形式式,例如如甲基化化碱基。对对于核苷苷酸的修修饰形式式,不得得在核苷苷酸序列列中直接接使用表表2中的符符号表示示,其具具体的表表述方式式见本标标准4.4.77节(1)和4.4.55节的内内容。(4)氨氨基酸:只包括括列于附附录1之表3中的存存在于天天然蛋白白质中的的L氨基基酸,不不包括DD氨基基酸。附附录1之表4中列出出的符号号用于表表述氨基基酸的修修饰形式式

6、,例如如羟基化化或糖基基化形式式。对于于氨基酸酸的修饰饰形式,不不得在氨氨基酸序序列中直直接使用用表4中的符符号表示示,其具具体的表表述方式式见本标标准4.4.77节(2)和4.4.55节的内内容。(5)序序列标识识符:对对应于序序列表中中每个序序列的序序列标识识号的唯唯一的正正整数。(6)数数字标识识符:由由尖括号号括括起来的的代表特特定内容容数据项项的三位位数字。4 序列列表和序序列表电电子文件件中的数数字标识识符、内内容及其其格式:在核苷酸酸和/或氨基基酸序列列表和序序列表电电子文件件中,应应当有本本标准中中指出的的数字标标识符,在在数字标标识符之之后(即即在其之之右,必必要时还还包括在

7、在其下面面的若干干行)是是相应的的具体内内容,它它们应当当符合本本标准规规定的格格式。附附录2给出了了一个说说明数字字标识符符、其后后内容及及格式的的序列表表样例。序列表和和序列表表电子文文件中包包括的数数字标识识符及相相应内容容和格式式具体如如下:4.1、序序列表和和序列表表电子文文件中的的著录项项目:下面4.1.114.11.7节节中的内内容应当当与专利利申请请请求书中中的相应应内容一一致。4.1.1、申申请人的的姓名或或名称:其数字字标识符符为。在数字标标识符之后后,是该该专利申申请的所所有申请请人的姓姓名或名名称。外国申请请人还应应当在中中文译名名之后注注明英文文姓名或或名称,并并将其

8、用用圆括号号括起来来。4.1.2、发发明名称称:其数数字标识识符为在数字标标识符之后后,是该该专利申申请的发发明名称称。4.1.3、案案卷参考考号:其其数字标标识符为为在数字标标识符之后后,是该该专利申申请的案案卷参考考号;没没有案卷卷参考号号的,无无需包括括此项内内容。4.1.4、专专利申请请号:其其数字标标识符为为对于首次次提交的的专利申申请,无无需包括括此项内内容;当当补交或或提交修修改时,在在数字标标识符之后后,是该该专利申申请的申申请号。4.1.5、专专利申请请日:其其数字标标识符为为对于首次次提交的的专利申申请,无无需包括括此项内内容;当当补交或或提交修修改时,在在数字标标识符之后

9、后,是该该专利申申请的申申请日,其其格式为为:YYYYYMMDD,例例如2000201118。4.1.6、优优先权号号:其数数字标识识符为没有优先先权的专专利申请请,无需需包括此此项内容容;如果果有优先先权的话话,那么么在数字字标识符符之之后,是是该专利利申请的的优先权权号,其其格式为为:世界界知识产产权组织织(WIPOO)标准准3(ST 3)的的国家、地地区和政政府间组组织代码码优先先权号,例例如,CCN93311223888.7。4.1.7、优优先权日日:其数数字标识识符为没有优先先权的专专利申请请,无需需包括此此项内容容;如果果有优先先权的话话,那么么在数字字标识符符之之后,是是该专利利

10、申请的的优先权权日,其其格式为为:YYYYYMMDD,例例如2000109220。4.2、序序列表电电子文件件的软件件版本信信息:其其数字标标识符为为当使用国国家知识识产权局局专利局局或其它它专利组组织(例例如欧洲洲专利局局)提供供的软件件形成核核苷酸和和/或氨基基酸序列列表电子子文件时时,在数数字标识识符之后,是是该软件件的名称称与版本本号;未未使用所所述软件件时,可可以不包包含此项项内容。4.3、序序列表中中序列的的个数:其数字字标识符符为。在数字标标识符之后后,是序序列的总总数,即即与数值值最大的的序列标标识符相相对应的的正整数数。4.4、序序列中的的各项内内容:4.4.1、序序列标识识

11、符:其其数字标标识符为为。在序列表表中,每每个序列列应当有有独立的的、唯一一的序列列标识符符,它应应当从11开始并并逐一增增加。序序列标识识符表示示每个序序列在序序列表中中的序号号。在数字标标识符之后后,是与与一个序序列相对对应的序序列标识识符。在一个序序列标识识符之后后到下一一个序列列标识符符之前是是该序列列的各项项具体内内容,即即下面44.4.24.44.7节节的内容容。在序列表表中有多多个序列列的情况况下,应应当按照照序列标标识符数数值从小小到大的的次序逐逐一填写写每个序序列的各各项内容容。4.4.2、序序列的长长度:其其数字标标识符为为。在数字标标识符之后后,是以以碱基或或氨基酸酸的数

12、目目表示的的该序列列的长度度。4.4.3、序序列的类类型:其其数字标标识符为为。在数字标标识符之后后,应当当指出该该序列的的分子类类型,有有DNAA、RNAA或PRTT三种类类型。如如果核苷苷酸序列列含有DDNA和和RNAA片段的的话,那那么其类类型应该该是DNNA;另另外,对对于DNNA/RRNA的的结合分分子,应应该在该该序列的的特征部部分(数数字标识识符)进进一步表表述。4.4.4、生生物体:其数字字标识符符为。在数字标标识符之后后,应当当用中文文和拉丁丁文(拉拉丁文应应当放在在中文之之后并用用圆括号号括起来来,例如如,草履履虫种(Parrameeciuum ssp.))注明明该序列列来

13、源的的生物名名称,即即科学命命名的生生物属种种;或者者是“人工序序列”或“未知”。4.4.5、序序列中特特征部分分的内容容:数字字标识符符本节涉及及到序列列中与特特征相关关的内容容的表述述。在核苷酸酸序列(数数字标识识符)中中含有“n”或修饰饰的碱基基的情况况下(参参见本标标准4.4.77节(1)的内内容),或或者在氨氨基酸序序列(数数字标识识符)中中含有“Xaaa”或修饰饰的氨基基酸或不不常用的的L氨基基酸的情情况下(参参见本标标准4.4.77节(2)的内内容),必必须包括括下面(1)(4)项的内容。在生物体体(数字字标识符符)是“人工序序列”或“未知”的情况况下,必必须包括括下面(1)和(

14、4)项的内容。在一个序序列中有有多个特特征的情情况下,应应当按照照这些特特征在序序列中出出现的先先后次序序逐一地地表述每每个特征征。序列中特特征部分分的具体体内容和和数字标标识符如如下:(1)特特征:其其数字标标识符为为。在数字标标识符之后后,应当当是空白白。(2)名名称/关键词词:其数数字标识识符为。在数字标标识符之后后,是特特征名称称或关键键词。使使用关键键词表述述特征时时,只能能使用附附录1之表5或表6中列出出的关键键词来表表述。(3)位位置:其其数字标标识符为为。在数字标标识符之后后,应当当标明特特征的位位置,标标注的方方式为:从特征征中的第第一个碱碱基或氨氨基酸的的编号到到特征的的最

15、后一一个碱基基或氨基基酸的编编号,编编号圆括括号括起起来,两两个编号号中间是是“.”,例如如:(2279).(3889) ;当序序列中使使用了多多个“n”或“Xaaa”时,应应当标明明它们的的所有位位置,例例如:(80,1000,1112)。参参见附录录2的序列列表样例例。(4)其其它信息息:其数数字标识识符为。在数字标标识符之后后,应当当表述序序列中与与特征有有关的其其它相关关信息。在在表述修修饰的碱碱基或修修饰的氨氨基酸时时,应该该用附录录1之表2或表4中给出出的符号号来表述述。4.4.6、出出版公开开信息:数字标标识符出版公开开信息是是非强制制性的内内容,在在序列表表和序列列表电子子文件

16、中中,可以以包含也也可以不不包含这这些内容容。(1)公公开出版版信息:其数字字标识符符为在数字标标识符之后后,应当当是空白白。(2)作作者:其其数字标标识符为为在数字标标识符之后后,是该该文献作作者的姓姓名。(3)题题目:其其数字标标识符为为在数字标标识符之后后,是出出版物中中该文献献的题目目。(4)杂杂志名称称:其数数字标识识符为在数字标标识符之后后,是公公开出版版物的杂杂志名称称。(5)公公开出版版物的卷卷号:其其数字标标识符为为在数字标标识符之后后,是公公开出版版物的卷卷号。(6)公公开出版版物的出出版号:其数字字标识符符为在数字标标识符之后后,是公公开出版版物的出出版号。(7)页页码:

17、其其数字标标识符为为在数字标标识符之后后,是该该文献的的起始终止页页码。(8)出出版日期期:其数数字标识识符为在数字标标识符之后后,是该该公开出出版物的的出版日日期,其其格式为为:YYYYYMMDD,例例如199990920。(9)公公开出版版物的数数据库登登记号:其数字字标识符符为如果该文文献被收收入某个个数据库库的话,那那么在数数字标识识符之后,是是该文献献在该数数据库中中的登记记号。(10)录录入数据据库的日日期:其其数字标标识符为为如果该文文献被收收入某个个数据库库的话,那那么在数数字标识识符之后,是是该文献献录入该该数据库库的日期期,其格格式为:YYYYYMMDD,例例如199990

18、920。(11)专专利公开开号:其其数字标标识符为为如果该公公开出版版物是专专利文献献的话,那那么在数数字标识识符之后,是是该专利利的公开开号,其其格式为为:世界界知识产产权组织织(WIIPO)标标准3(ST 3)的的国家、地地区和政政府间组组织代码码标准准6(ST 6)的的公开号号标准准16(ST 16)的的文献类类型,例例如CNN118831117A。(12)专专利申请请日:其其数字标标识符为为如果该公公开出版版物是专专利文献献的话,那那么在数数字标识识符之后,是是该专利利的申请请日,其其格式为为:YYYYYMMDD,例例如199990920。(13)专专利公开开日:其其数字标标识符为为如

19、果该公公开出版版物是专专利文献献的话,那那么在数数字标识识符之后,是是该专利利的公开开日,其其格式为为:YYYYYMMDD,例例如199990920。4.4.7、核核苷酸序序列和/或氨基基酸序列列:其数数字标识识符为。在数字标标识符之后后,是该该序列的的序列标标识符;从下一一行开始始是该核核苷酸和和/或氨基基酸序列列。该序列可可以是纯纯核苷酸酸序列,或或者是纯纯氨基酸酸序列,或或者是核核苷酸序序列和与与它对应应的氨基基酸序列列。(1)纯纯核苷酸酸序列:核苷酸序序列应当当只用单单链表示示,从左左到右是是5-末端至至3-末端的的方向,序序列中不不应当出出现术语语5和3。应当用单单字母代代码表示示核

20、苷酸酸序列的的碱基来来表述核核苷酸序序列的特特征;只只能使用用与附录录1之表1中给出出的符号号相一致致的小写写字母来来表示。在一个核核苷酸序序列中,如如果经修修饰的碱碱基是附附录1之表2中列出出的之一一,那么么在该序序列本身身中,应应当用未未修饰的的碱基或或“n”来表示示该经修修饰的碱碱基,符符号“n”等同于于唯一的的一个未未知的或或经修饰饰的核苷苷酸;但但在该序序列的特特征部分分(数字字标识符符)应应当使用用附录11之表2中给出出的符号号进一步步表述该该修饰(参参见本标标准4.4.55节)。附附录1之表2中的符符号可以以用于说说明书或或序列的的特征部部分,但但不得用用于序列列本身。核苷酸序序

21、列中碱碱基的编编号开始始于序列列中的第第1个碱基基,并从从5到3方向向连续地地计数。该该计数方方法也用用于构型型为环状状的核苷苷酸序列列,在这这种情况况下,申申请人可可任意指指定序列列的第一一个核苷苷酸。来自大序序列的一一个或更更多非邻邻接区段段或来自自不同序序列的区区段组成成的核苷苷酸序列列,应当当作为带带有单独独序列标标识符的的单独序序列来计计数。带带有一个个缺口或或多个缺缺口的序序列应当当作为带带有单独独序列标标识符的的多个单单独序列列来计数数,而单单独序列列的数目目与序列列数据的的连续序序列的数数目相同同。核苷酸序序列每行行最多660个核核苷酸碱碱基,每每10个核核苷酸碱碱基后空空一格

22、。该该行的最最后是该该行最后后一个碱碱基的编编号。(2)纯纯氨基酸酸序列:对于氨基基酸序列列,蛋白白质或肽肽序列中中的氨基基酸应当当从左到到右以氨氨基到羧羧基的方方向列出出;序列列中不应应当出现现氨基或或羧基基基团。氨基酸应应当使用用与附录录1之表3中的符符号相一一致的、第第一个字字母大写写的三字字母符号号表示。有有空白或或内部中中止符号号(例如如“Terr”或“*”或“”)的的氨基酸酸序列不不应当表表示为单单个氨基基酸序列列,而应应当作为为独立的的氨基酸酸序列分分别列出出。在一个氨氨基酸序序列中,如如果经修修饰的氨氨基酸是是附录11之表4中列出出的氨基基酸之一一,那么么在该序序列本身身中,应

23、应当用相相应的未未经修饰饰的氨基基酸或“Xaaa”来表示示该经修修饰的和和不常用用的氨基基酸,符符号“Xaaa”等同于于唯一的的一个未未知的或或经修饰饰的氨基基酸;但但在该序序列的特特征部分分(数字字标识符符),应应当使用用附录11之表4中给出出的符号号进一步步表述该该修饰(参参见本标标准4.4.55节)。附附录1之表4中的符符号可以以用于说说明书或或序列的的特征部部分,但但不得用用于序列列本身。氨基酸的的编号开开始于序序列中的的第1个氨基基酸,以以数字11表示并并标注在在该氨基基酸的下下面;以以后每隔隔5个氨基基酸在其其下面标标注上该该氨基酸酸的编号号。当成成熟蛋白白质之前前存在氨氨基酸时时

24、,例如如对于前前序列列,原序列,前前原序列和和信号序序列而言言,可以以任选地地从与成成熟蛋白白第一个个氨基酸酸相邻的的氨基酸酸开始以以负数往往回编号号。当氨氨基酸编编号使用用负数以以区分成成熟蛋白白质时,不不得使用用数字00。上述述氨基酸酸序列的的计数方方法也适适用于环环状构型型的氨基基酸序列列,申请请人可以以任意指指定第一一个氨基基酸。来自大序序列的一一个或更更多非邻邻接区段段或不同同序列的的区段组组成的氨氨基酸序序列,应应当作为为具有单单独序列列标识符符的单独独序列来来计数。具具有一个个缺口或或多个缺缺口的序序列应当当作为具具有单独独序列标标识符的的多个单单独序列列来计数数,单独独序列的的

25、数目与与序列数数据的连连续序列列的数目目相同。氨基酸序序列每行行最多116个氨氨基酸,每每个氨基基酸之间间空一格格。(3)核核苷酸序序列和与与它对应应的氨基基酸序列列:对于核苷苷酸序列列和与它它对应的的氨基酸酸序列,对对应于其其编码的的氨基酸酸的核苷苷酸序列列的碱基基应当以以“三联体体”密码子子列出,每每个密码码子之间间应当空空一格;对应于于核苷酸酸序列的的编码部部分的氨氨基酸可可以直接接列于相相应密码码子的下下方;对对于该氨氨基酸序序列,应应当在第第一个氨氨基酸的的下面标标注上编编号1,然后后每隔55个氨基基酸在其其下面标标注上该该氨基酸酸的编号号。对于这种种核苷酸酸和其编编码的氨氨基酸序序

26、列的混混合形式式,与核核苷酸序序列相对对应的氨氨基酸序序列还应应当以纯纯氨基酸酸序列的的形式另另外给出出。4.5 数字标标识符连连同其后后内容的的排列格格式在本节中中,“数字标标识符及及内容”指的是是数字标标识符连连同其后后的相应应内容。数字标识识符及内内容应当当按照数数字标识识符的数数值从小小到大的的次序排排列在序序列表中中。每个数字字标识符符及内容容之间应应当空一一行,不不过在前前两位数数字相同同的数字字标识符符及内容容之间,例例如到之之间和到之之间,无无需空一一行,但但对于一一个序列列中有多多个特征征的情况况,在表表述每个个特征时时,每个个数字标标识符之前前应当空空一行。对于序列列表中有

27、有多个序序列的情情况,数数字标识识符及内内容应当当按照序序列标识识符的数数值从小小到大的的次序排排列。在在每个序序列中,应应当按照照数字标标识符数数值从小小到大的的次序列列出仅仅仅与该序序列有关关的数字字标识符符及内容容,即排排列上从从到到的的数字标标识符及及内容。对于一个个序列中中有多个个特征的的情况,应应当按照照这些特特征在序序列中出出现的先先后次序序逐一排排列从到的的数字标标识符及及内容。5、序列列表电子子文件的的格式5.1、序序列表电电子文件件是一个个包含上上述第44部分的的数字标标识符和和内容,并并符合上上述第44部分格格式要求求的纯文文本文件件;该文文件应当当使用中中华人民民共和国

28、国颁布的的信息交交换用汉汉字编码码字符集集标准。5.2、序序列表电电子文件件应当记记录在CCD-RROM光光盘或33.5英英寸软盘盘上提交交,或者者按照国国家知识识产权局局专利局局规定的的其它形形式提交交。当记记录在CCD-RROM光光盘上时时,该CCD-RROM光光盘应当当采用IISO996600标准刻刻录;当当记录在在3.55英寸软软盘上时时,该软软盘应当当符合FFAT 12格格式。该该光盘或或软盘的的目录结结构如下下:在根根目录下下,有且且仅有一一个后缀缀名为“.SEEQ”的纯文文本文件件。6 其它它事项6.1、申申请人应应当保证证提交的的计算机机可读形形式的序序列表电电子文件件中的内内

29、容与纸纸件形式式的序列列表完全全相同。6.2、申申请人在在形成符符合本标标准的序序列表电电子文件件时,可可以使用用国家知知识产权权局专利利局提供供的序列列表编辑辑软件来来形成;也可以以使用其其它专利利组织提提供的软软件(例例如欧洲洲专利局局提供的的Pattenttin)来来形成;还可以以使用任任何纯文文本文件件编辑软软件来形形成。无无论使用用何种软软件,所所形成的的电子文文件都必必须符合合本标准准的规定定。6.3、当当申请人人以光盘盘或软盘盘的形式式提交序序列表电电子文件件时,应应当在提提交的光光盘或软软盘上贴贴有永久久性标记记,注明明申请人人姓名或或名称、发发明名称称、光盘盘或软盘盘中的文文

30、件名和和提交日日期;申申请人委委托了代代理人的的,也可可以任选选地标注注上代理理机构给给该申请请的案卷卷号。对对于申请请人补交交或提交交修改的的情况,应应当注明明申请号号并注明明“补交”或“修改”。注明申请请人姓名名或名称称等项内内容时,应应当使用用本标准准中的数数字标识识符,即即应当标标注上数数字标识识符,并并在其后后注明具具体内容容,例如如: 基因开开发有限限公司。注注明提交交日期的的格式为为:YYYYYMMDD。当序列表表电子文文件的字字节数太太大不能能记录在在一张软软盘上时时,应当当将序列列表电子子文件记记录在一一张光盘盘上提交交。7 颁布布和实施施本标准由由中华人人民共和和国国家家知

31、识产产权局颁颁布,自自20001年11月1日起实实施。中华人民民共和国国国家知知识产权权局二一一年十一一月一日日附录1 核苷酸酸和氨基基酸符号号和特征征关键词词表表1 核核苷酸表表符号含义名称的来来源aa腺嘌呤gg鸟嘌呤cc胞嘧啶tt胸腺嘧啶啶rg或a嘌呤yt/u或或c嘧啶ma或c氨基kg或t/u酮基sg或c弱作用键wa或t/u强作用键bg或c或或t/uu非ada或g或或t/uu非cha或c或或t/uu非gva或g 或c非t,非非una或g或或c或t/uu,未知知,或其其它任何表2 经经修饰的的核苷酸酸表符号含义ac4cc乙酰酰胞苷chm55u(羧羧羟甲基基)尿苷苷cmOO甲基基胞苷cmnmm

32、5s22u羧甲甲基氨甲甲基硫代代尿苷cmnmm5u羧甲甲基氨甲甲基尿苷苷d二氢尿苷苷fmOO甲基基假尿苷苷gal q,D半乳糖糖Q核苷苷gmOO甲基基鸟苷i肌苷i6a异异戊烯基基腺苷mla甲基基腺苷mlf甲基基假尿苷苷mlg甲基基腺苷mli甲基基肌苷m22gg二甲基基腺苷m2a甲基基腺苷m2g甲基基鸟苷m3c甲基基胞苷m5c甲基基胞苷m6a甲甲基腺苷苷m7g甲基基鸟苷mam55u甲基基氨基甲甲基尿苷苷mam55s2uu甲氧氧基氨基基甲基硫硫代尿苷苷man q,D甘露糖糖Q核苷苷mcm55s2uu甲氧氧基羰基基甲基硫硫代尿苷苷mcm55u甲氧氧基羰基基甲基尿尿苷mo5uu甲氧氧基尿苷苷ms2ii

33、6a硫代代甲基异戊烯烯基腺苷苷ms2tt6a(呋喃核核糖基硫硫代甲基基嘌呤l)氨基基甲酰)苏苏氨酸mt6aa(呋喃核核糖嘌呤呤yl)N甲基基氨基甲甲酰)苏苏氨酸mv尿苷氧化化乙酸甲基酯酯o5u尿苷氧化化乙酸osywwwybuutoxxosiinep假尿苷qQ核苷s2c硫代代胞苷s2t甲基基硫硫代尿苷苷s2u硫代代尿苷s4u硫代代尿苷t甲基基尿苷t6a(呋喃核核糖嘌呤呤基)氨基甲甲酰)苏苏氨酸tm甲基基甲基尿尿苷um甲基基尿苷ywWybuutossineex(氨基基羧基丙其)尿尿苷,(acp3)u表3 三三字母表表示的氨氨基酸表表符号含义Ala丙氨酸Cys半胱氨酸酸Asp天冬氨酸酸Glu谷氨酸P

34、he苯丙氨酸酸Gly甘氨酸His组氨酸Ile异亮氨酸酸Lys赖氨酸Leu亮氨酸Met蛋氨酸Asn天冬酰酸酸Pro脯氨酸Gln谷氨酰胺胺Arg精氨酸Ser丝氨酸Thr苏氨酸Val缬氨酸Trp色氨酸Tyr酪氨酸Asx天冬氨酸酸或天冬冬酰胺Glx谷氨酸或或谷氨酰酰胺Xaa未知或其其它表4 经经修饰的的和不常常用的氨氨基酸表表符号含义Aad氨基基已二酸酸bAadd氨基基已二酸酸bAlaa一丙氨氨酸,一氨基基丙酸Abu氨基基丁酸4Abuu氨基基丁酸,哌哌啶酸Acp氨基基已酸Ahe氨基基庚酸Aib氨基基异丁酸酸bAibb氨基基异丁酸酸Apm氨基基庚二酸酸Dbu,二二氨基丁丁酸Des赖氨素Dpm,二氨氨基庚

35、二二酸Dpr,二氨基基丙酸EtGlly乙基基甘氨酸酸EtAssn乙基基天冬氨氨酸Hyl羟基赖氨氨酸aHyll别羟基基赖氨酸酸3Hypp羟基基脯氨酸酸4Hypp羟基基脯氨酸酸Ide异赖氨素素aIlee别异亮亮氨酸MeGlly甲基基甘氨酸酸,肌氨氨酸MeIlle甲基基异亮氨氨酸MeLyys甲基赖赖氨酸MeVaal甲基基缬氨酸酸Nva正缬氨酸酸Nle正亮氨酸酸Orn鸟氨酸表5 与与核苷酸酸序列相相关的特特征关键键词表关键词说明alleele相关的个个体或菌菌株含有有相同基基因的稳稳定的其其它形式式,该形式式区别于于这一位位置的现现有的序序列(和或许许其它序序列)atteenuaatorr(1) 存在

36、调节节转录的的终止的的DNAA区域,它控制制了一些些细菌操操纵子的的表达; (2)位位于启动动子和第第一个结结构基因因之间,引引起转录录的部分分终止的的序列区区段C_reegioon免疫球蛋蛋白轻和和重链的的恒定区区,和T-细胞胞受体,和链;根根据特定定的链可可包括一一个或多多个外显显子CAATT_siignaalCAATT盒;位于可可能参与与RNAA聚合酶酶结合的的真核生生物转录录单位的的起始点点的755bp上上游的保保守序列列的一部部分;共共有序列列GGG(C或或T)CCAATTCTCDS编码序列列;对应于于蛋白质质中的氨氨基酸序序列的核核苷酸的的序列(位置包包括终止止密码子子);特征征包

37、括氨氨基酸概概念上的的翻译Confflicct在这一位位点或区区域,单独确确定的“相同”序列有有所不同同D-looop置换环;线粒体体DNA内的一一个区域域,其中RNNA的短短的序列列与DNNA的一一条链配配对,代替了了这一区区域的原原始配对对DNAA链;也用于于说明在在ReccA蛋白白质催化化的反应应中,侵侵入的单单链替代代双链DDNA的的一条链链的区域域D-seegmeent免疫球蛋蛋白重链链的多变变区,和T-细胞胞受体的的链Enhaanceer顺式-作作用序列列,它增强强了(一些)真核生生物启动动子的作作用,并能在在任一方方向和与与启动子子相关的的任何位位置处 (上游游或下游游)起作用用

38、Exonn编码剪接接mRNNA部分分的基因因组区域域;可以含含有5UTRR,所有有CDSS,和3UUTRGC_ssignnalGC盒;位于真真核生物物转录单单位起始始点上游游的保守守的富含含GC区域域,可以以以多重拷拷贝或任任一方向向存在;共有序序列=GGGGCCGGgenee鉴定为基基因的生生物学意意义的区区域,并已经经指定名名称iDNAA间插DNNA;通通过几种种重组中中的任何何一种能能被消除除的DNNAintrron被转录的的DNAA区段,但通过过同时剪剪接位于于其两侧侧的序列列(外显子子)即可从从转录本本内部将将其除去去J_seegmeent免疫球蛋蛋白轻链链和重链链的连接接区段,和T

39、-细胞胞受体,和链LTR长的末端端重复,在确定定序列的的两端直直接重复复的序列列, 类型型典型地地见于逆逆转录病病毒中mat_pepptidde成熟的肽肽或蛋白白质的编编码序列列;翻译后后修饰之之后成熟熟的或最最终的肽肽或蛋白白质产物物的编码码序列;位置不不包括终终止密码码子(与相应应的CDDS不同同)miscc_biindiing不能用任任何其它它Binndinng关键键词(pprimmer_binnd或prooteiin_bbindd)表述述的与另另一个组组成成分分共价或或非-共价结结合的核核酸中的的位点miscc_difffereencee特征序列列与记载载中存在在的有所所不同,并且不不

40、能用任任何其它它不同关关键词(connfliict,unssuree,olld_ssequuencce,mmutaatioon,vvariiatiion,alllelee或moddifiied_basse)表表述miscc_feeatuure不能用任任何其它它的特征征关键词词表述的的具有生生物学意意义的区区域;新的或或少见的的特征miscc_reecommb任何一般般性的,位点特特异性的的或复制制的重组组事件的的位点,该位点点中有不不能用其其它重组组关键词词(iDDNA和和virrionn)或来来源关键键词的修修饰词(/trranssposson,/prroviirall)表述述的双螺螺旋DN

41、NA的断断裂和愈愈合miscc_RNNA不能用其其他RNNA关键键词(pprimm_trransscriipt,preecurrsorr_ RNAA,mRRNA,5cliip,33cllip,5UUTR,3UUTR,exoon,CCDS,sigg_peeptiide,traansiit_ _pepptidde,mmat_pepptidde,iintrron,pollyA_siite,rRNAA,tRRNA,scRRNA和和snRRNA)限定的的任何转转录本或或RNAA产物miscc_siignaal含有控制制或改变变基因功功能或表表达之信信号的任任何区域域,所述信信号不能能用其他他Siggna

42、ll关键词词(prromooterr,CAAAT_siggnall,TAATA_siggnall,-335_ssignnal,10_siggnall,GCC_siignaal,RRBS,pollyA_siignaal,eenhaanceer,aatteenuaatorr,teermiinattor,和repp_orrigiin)表表述miscc_sttruccturre不能用其其他Sttruccturre关键键词(sstemm_looop和和D-lloopp)表述述的任何何二级或或三级结结构或构构象modiifieed_bbasee被指示的的核苷酸酸是经修修饰的核核苷酸,并应由由被指示示的分子子(在modd_baase修修饰词意意义中给给出)所取代代mRNAA信使RNNA;包包括5非翻译译区(55UTTR),编编码序列列(CDDS,外外显子)和非翻译译区(UTTR)mutaatioon在此位置置处,相相关品系系的序列列中具有有突然的的,可遗遗传的变变化N_reegioon在重排的的免疫球球蛋白区区段之间间插入的的额外的的核苷酸酸Old_seqquennce在此位置置处,所所表述的的序列修修改了此此序列以以前的版版本Po

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