动物生物化学 知识点复习.ppt

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1、动物生物化学 知识点复习 第1章 绪论生物化学(Biochemistry):是生命的化学,是从分子水平上阐明生命有机体的化学规律以揭示生命现象本质的科学。生物化学研究生命有机体的化学组成及其结构与功能的关系,研究细胞中的物质代谢和与之相伴随的能量转换过程,研究机体组织器官机能的生化机理。研究生物体内各种化合物的结构、化学性质和功能(主要有糖类、脂类、蛋白质、核酸、酶、维生素和激素)研究构成生物体的基本物质在生命活动中进行的化学变化,即新陈代谢及代谢过程中能量的转换和调节生物化学研究的内容代谢与能量代谢与能量糖类化学糖类化学脂类化学脂类化学蛋白质化学蛋白质化学核酸化学核酸化学酶学酶学糖类代谢糖类

2、代谢脂类代谢脂类代谢蛋白质代谢蛋白质代谢核酸代谢核酸代谢代谢调节代谢调节蛋白质的降解蛋白质的降解氨基酸代谢氨基酸代谢蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成核酸的降解核酸的降解核苷酸代谢核苷酸代谢核酸的生物合成核酸的生物合成生物化学研究的内容 第2章 生命的化学特征2.2 生物体系中的非共价作用力 存在于生物分子中主要的非共价相互作用力包括:氢键、离子键、范德华力、疏水力。2.4 生物能量学 Adenosine Triphosphate,ATP:三磷酸腺苷 第3章 蛋白质(protein)3.3 蛋白质的化学组成 主要的:C H O N S 5055%68%2023%1518%1518%04%微量的:

3、P Fe Cu Zn Mo I Se3.3.1 元素组成各各元元素素的的百百分分比比对对于于大大多多数数蛋蛋白白质质都都较较相相似似,大多数蛋白质含氮量较恒定,平均16%,即1g氮相当于6.25g蛋白质。6.25称为蛋白质系数。这可用于测定蛋白质的含量这可用于测定蛋白质的含量凯氏定氮法凯氏定氮法。样品中蛋白质含量=样品中的含氮量 6.25 第3章 蛋白质(protein)3.3.2 蛋白质的基本结构单元v蛋白质的基本结构单元是氨基酸蛋白质的基本结构单元是氨基酸 amino acidamino acidv多个氨基酸首尾多个氨基酸首尾连结(连接方式:连结(连接方式:肽键肽键)形成)形成长而不分支的

4、多聚物长而不分支的多聚物多多肽链肽链 v多多肽链再折叠卷曲,形成蛋白质肽链再折叠卷曲,形成蛋白质 第3章 蛋白质(protein)v2020种氨基酸种氨基酸 分类分类v氨基酸的主要理化性质氨基酸的主要理化性质v蛋白质的结构、理化性质蛋白质的结构、理化性质1.定义 1969年,国际纯化学与应用化学委员会(IUPAC)规定:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序,包括二硫键的位置。一、蛋白质的一级结构2.一级结构的意义 蛋白质的一级结构是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序。蛋白质的化学结构包括肽链数目、端基组成、氨基酸序列和二硫键的位置,又称共价结构。蛋白质的一级结构是最基本的结构,它决定着蛋

5、白质高级结构。一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键。蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链主链原子局部的空间结构,但不包括与其他肽段的相互关系及侧链构象的内容。(一)二级结构的概念 二二.蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构 天然蛋白质包括-螺旋、-折叠、-转角、无规则卷曲等二级结构。1.1.超二级结构的定义超二级结构的定义 指指蛋蛋白白质质中中相相邻邻的的二二级级结结构构单单位位(即即单单个个-螺螺旋旋或或-转转角角)组组合在一起,形成有规则的在空间上能辩认的二级结构组合体。合在一起,形成有规则的在空间上能辩认的二级结构组合体。三三.蛋白质的超二级结构和结构

6、域蛋白质的超二级结构和结构域2 2.结构域结构域(domain)domain)指指多多肽肽链链在在二二级级结结构构或或超超二二级级结结构构的的基基础础上上形形成成三三级级结结构构的的局局部部折折叠叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域(区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域(domaindomain)或功能域。或功能域。四四.蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构 三三级级结结构构:指指的的是是多多肽肽链链在在二二级级结结构构、超超二二级级结结构构和和结结构构域域的的基基础础上上,主主链链构构象象和和侧侧链链构构象象相相互互作作用用,进进一一步步盘盘曲曲折折叠叠形形成成球球状状分分子结构。

7、子结构。(一)三级结构的概念(一)三级结构的概念(三)维持三级结构的作用力二硫键二硫键 共价键共价键 疏水作用疏水作用非共价键(次级键)非共价键(次级键)氢键氢键 离子键离子键范德华力范德华力稳定蛋白质三维结构的作用力稳定蛋白质三维结构的作用力1 1 离子键离子键 2 2 氢键氢键 3 3 疏水作用疏水作用 4 4 范德华引力范德华引力 5 5 二硫键二硫键五五.蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构(一一)四级结构的概念四级结构的概念 四级结构四级结构:由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成、由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成、有特定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为亚基。有特

8、定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为亚基。血红蛋白由四条多肽链形成,是一种寡聚蛋白质。这四条链主要血红蛋白由四条多肽链形成,是一种寡聚蛋白质。这四条链主要通过非共价键相互作用缔合在一起。血红蛋白分子上有四个氧的结通过非共价键相互作用缔合在一起。血红蛋白分子上有四个氧的结合部位,因为每条链上含有一个血红素辅基。合部位,因为每条链上含有一个血红素辅基。(一一)四级结构的概念四级结构的概念()有关四级结构的一些概念有关四级结构的一些概念 亚基亚基(单体单体),同多聚,杂多聚,同多聚,杂多聚()四级缔合的驱动力四级缔合的驱动力 主要有范氏作用力,氢键,离子键和疏水作用力,其中主要有范氏作用力,氢键

9、,离子键和疏水作用力,其中疏水作用力疏水作用力最最为重要,二硫键对于稳定四级结构有重要意义。为重要,二硫键对于稳定四级结构有重要意义。()亚基相互作用的方式亚基相互作用的方式 亚基之间的分布有各种各样的对称关系。亚基之间的分布有各种各样的对称关系。第第4 4章章 核酸核酸核酸的一级结构核酸的一级结构:一分子核苷酸的:一分子核苷酸的3-3-位羟基与另一分子核苷酸的位羟基与另一分子核苷酸的5-5-位磷酸基通过脱水可形成位磷酸基通过脱水可形成3,5-3,5-磷酸二酯键磷酸二酯键,将两分子核苷酸连接起来。,将两分子核苷酸连接起来。核酸就是由多个核苷酸单位核酸就是由多个核苷酸单位通过通过3,5-3,5-

10、磷酸二酯键磷酸二酯键连接连接起来形成的不含侧链的长链起来形成的不含侧链的长链状化合物。状化合物。核酸是有方向性的长链状化核酸是有方向性的长链状化合物,多核苷酸链的两端,合物,多核苷酸链的两端,一端称为一端称为5-5-端,另端,另 一端称一端称为为3-3-端端。核酸是生物体内的高分子化合物,包括核酸是生物体内的高分子化合物,包括脱氧核糖核酸(脱氧核糖核酸(DNADNA)和和核糖核酸(核糖核酸(RNARNA)两大类。两大类。一、元素组成一、元素组成组成核酸的元素有组成核酸的元素有C C、H H、O O、N N、P P等,与蛋白质比较,其等,与蛋白质比较,其组成上有两个特点:一是组成上有两个特点:一

11、是核酸一般不含元素核酸一般不含元素S S,二是,二是核酸中核酸中P P元素元素的含量较多并且恒定,约占的含量较多并且恒定,约占9-10%9-10%(通常取(通常取9.5%9.5%)。因此,核酸定。因此,核酸定量测定的经典方法,是以测定量测定的经典方法,是以测定P P含量来代表核酸量。含量来代表核酸量。二、化学组成与基本单位二、化学组成与基本单位核酸经水解可得到很多核酸经水解可得到很多核苷酸核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本单,因此核苷酸是核酸的基本单位。核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可位。核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可被水解产生被水解产生核苷和磷酸核苷和磷

12、酸,核苷还可再进一步水解,产生,核苷还可再进一步水解,产生戊糖和含戊糖和含氮碱基氮碱基。两类核酸的分子组成两类核酸的分子组成RNARNADNADNA组组 分分磷磷 酸酸磷磷 酸酸戊戊 糖糖核核 糖糖脱氧核糖脱氧核糖碱碱基基嘌嘌 呤呤嘧嘧 啶啶A GA GU UC CT T核苷酸的紫外吸收核苷酸的紫外吸收 碱基中含有共轭双键,碱基中含有共轭双键,最大吸收峰最大吸收峰 260 nm 260 nm 左右左右核酸溶液紫外吸收核酸溶液紫外吸收以以摩尔磷的吸光度摩尔磷的吸光度表示,表示,摩尔磷即相当于摩尔核苷酸。摩尔磷即相当于摩尔核苷酸。:摩尔吸光系数:摩尔吸光系数A A:吸收值:吸收值 WW:每升溶液磷

13、重量:每升溶液磷重量L L:比色杯内径:比色杯内径由于共振作用,所有核苷酸的碱基都吸收紫外由于共振作用,所有核苷酸的碱基都吸收紫外光,核酸在光,核酸在 260 nm 260 nm 附近有强大光吸收。附近有强大光吸收。第第5 5章章 糖类糖类 单糖单糖是指最简单的糖,即在温和条件下不能再分解成更小的单体糖,是指最简单的糖,即在温和条件下不能再分解成更小的单体糖,如如葡萄糖、果糖葡萄糖、果糖等。按碳原子的数目单糖又可分为三碳(丙)糖、四等。按碳原子的数目单糖又可分为三碳(丙)糖、四碳(丁)糖、五碳(戊)糖、六碳(已)糖、七碳(庚)糖等。碳(丁)糖、五碳(戊)糖、六碳(已)糖、七碳(庚)糖等。糖类的

14、本质:糖类的本质:多羟基多羟基醛、醛、多羟基多羟基酮酮多羟基多羟基醛醛或多羟基或多羟基酮酮的的衍生物衍生物三三糖糖甘油醛甘油醛 二羟丙酮二羟丙酮一、一、一些重要单糖的结构一些重要单糖的结构五五碳碳糖糖核核 糖糖核酮糖核酮糖木木 糖糖六六碳碳糖糖葡萄糖葡萄糖果糖果糖一、一、一些重要单糖的结构一些重要单糖的结构 麦芽糖麦芽糖-葡萄糖(葡萄糖(1414)葡萄糖苷)葡萄糖苷一、一、一些重要双糖的结构一些重要双糖的结构 蔗蔗 糖糖-葡葡萄萄糖糖(1 12 2)-果果糖糖苷苷 一、一、一些重要双糖的结构一些重要双糖的结构 乳乳 糖糖乳糖(半乳糖乳糖(半乳糖-1,4-1,4-葡萄糖)葡萄糖)一、一、一些重要

15、双糖的结构一些重要双糖的结构 淀淀 粉粉直链:a-1,4-糖苷键分支点:a-1,6-糖苷键一、一、一些重要多糖的结构一些重要多糖的结构 淀淀 粉粉直链:a-1,4-糖苷键分支点:a-1,6-糖苷键 纤纤 维维 素素b-1,4-糖苷键一、一、一些重要多糖的结构一些重要多糖的结构植物细胞壁的主要组分,也是自然界最丰富的多糖。植物细胞壁的主要组分,也是自然界最丰富的多糖。第第7 7章章 酶酶(EnzymeEnzyme)动物生物化学动物生物化学期末考试题型期末考试题型一、英译汉(一、英译汉(5 5分)分)二、单选题(二、单选题(3030分)分)三、判断题(三、判断题(1010分)分)四、论述题(共四、论述题(共5 5道,道,5555分)分)五、附加题(五、附加题(5 5分)分)国际酶学委员会根据酶催化的反应类型,将酶分为6大类,请写出该6大类酶的中英文中英文名称。Thank You世界触手可及世界触手可及携手共携手共进,齐创精品工程精品工程

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