8.1 NCBI相关资源.pdf

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1、NCBI相关资源 NCBI 美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)，提供生物医学和基因组信息。https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI Gene数据库整合各类别信息，包括命名法、参考序列、定位、通路、变异、表型以及基因组、表型和位点特异性资源的链接。Gene https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/gene 查询界面 Gene 基因名+物种 查询界面 Gene 基因名 基因描述界面 Gene https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2700 Gene

2、 https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2700 NCBIGeneGenBank 物种：数据包括不同物种来源(Organism)记录：每条数据记录包含对序列简要描述，命名、物种分类、参考文献、序列特征表和序列本身等。序列特征表(FEATURES)：包含对序列生物学特征的注释，如exon、mRNA和CDS等。编号(ACCESION)：唯一性和永久性，文献引用序列时以此为准。版本号(VERSION)编码区(CDS)：17757.19064 GenBank 查询界面 GenBank https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/NCBIGeneG

3、enBank 描述界面 GenBank GenBank 关键信息 基因序列：ORIGIN开始，/结束，中间为碱基序列。GenBank GenBank Gene 序列格式：FASTA格式显示方式 GenBank Gene FASTA格式，表示新文件开始 dbSNP 单核苷酸多态性数据库 Single Nucleotide Polymorphism database 变异数据库：包括单核苷酸多态性(SNP)和小型变异如揑入/缺失、微卫星和非多态性变异。https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/dbSNP dbSNP查询界面：基因变异 GeneView dbSNP dbSNP界

4、面：cSNP dbSNP dbSNP界面：in gene region dbSNP dbSNP界面：in gene region 变异位置和变异类型 dbSNP rs#:rs398122937 dbSNP dbSNP rs398122937 OMIM OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)：在线人类孟德尔遗传数据库，人类基因和遗传表型数据库，包括人类遗传病、遗传决定性状及其相关基因。https:/omim.org/https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/OMIM 独特的六位编号表示疾病，第一位代表遗传方式：1-常染色体显性遗

5、传，2-常染色体隐性遗传（1994.5.15前），3-X-连锁，4-Y-连锁，5-线粒体遗传，6-常染色体遗传（1994.5.15后）也有编号表示基因 OMIM编号前符号：*#+%OMIM 查询*121015#601885 PubMed 生物医学信息检索系统，包括来自MEDLINE、生命科学期刊和在线图书的生物医学文献，包含PubMed Central(PMC)和出版商网站的全文链接。https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/PubMed 引文和摘要涉及生物医学和健康领域，涵盖部分生命科学、行为科学、化学科学和生物工程。PubMed还提供访问其他相关网站以及其他NC

6、BI分子生物学资源的链接。高级检索 基本检索 PubMed 常用检索字段 单位AD 作者AU 期刊TA 标题TI PMID 发表时间DP PubMed Advanced Search：检索词+发表时限 PubMed 检索结果过滤 1 2 PubMed 加入我的参考书目 1 2 PubMed 显示格式 摘要 PubMed 文献详情 全文链接 PubMed 文献详情 全文链接 PMC PubMed Central(PMC)是NIH/NLM的生物医学和生命科学期刊文献的免费全文档案。Free Access:A Core Principle of PMC https:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/PMC PMC