杨荣武生物化学基本知识氨基酸.ppt

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1、第一章 氨基酸的结构与功能,提纲,一、氨基酸的结构、种类和分类 氨基酸的结构通式 蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸 疏水氨基酸和亲水氨基酸 必需氨基酸与非必需氨基酸 二、氨基酸的性质与功能 缩合 手性(Gly除外) 酸碱解离性质与两性离子 R基团的结构变化和化学反应性质 三、氨基酸的分离与纯化 层析 离子交换层析,氨基酸的结构通式,不同的侧链基团,不同的理化性质,蛋白质氨基酸,即标准氨基酸在蛋白质生物合成中,由专门的tRNA携带,直接参入到蛋白质分子之中 共22种:20种常见+2种不常见 相同的结构通式 差别在侧链基团(R基团) 所有的生物体都含有常见的20种 2种不常见的蛋白质氨基酸:含硒半胱氨

2、酸(第21种)和吡咯赖氨酸(第22种) 非蛋白质氨基酸不能直接参入到蛋白质分子之中,或者是蛋白质氨基酸翻译后修饰产物 例如:瓜氨酸、鸟氨酸和羟脯氨酸,蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸,脂肪族 芳香族 含硫族 极性/不带电荷 碱性/酸性,疏水:非极性R基团,亲水:极性的R基团(电中性、带负电荷、带正电荷),氨基酸的分类,亲水氨基酸,即极性氨基酸,其R基团呈极性,一般能和水分子形成氢键,故对水分子具有一定的亲和性。它们包括:Ser、Thr、Tyr、Cys、Sec、Asn、Gln、Asp、Glu、Pyl、Arg、Lys、His; 疏水氨基酸,即非极性氨基酸,其R基团呈非极性,对水分子的亲和性不高或者极低

3、,但对脂溶性物质的亲和性较高。它们包括:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Met、Phe和Trp。,亲水氨基酸VS疏水氨基酸,不带电荷的非极性氨基酸,不带电荷的极性氨基酸,三种芳香族氨基酸,带电荷的极性氨基酸,含硒半胱氨酸只存在于含硒蛋白之中,而吡咯赖氨酸仅存在于一些原核生物体内,作为与产甲烷代谢有关的某些酶的组分。,氨基酸的分类图解,词记亲水氨基酸与疏水氨基酸,西湖景,紫竹为骨水潺潺横笛相伴,闲听天簌静思禅流苏落,心比双丝郁中缠亲水氨基酸:西-硒代半胱氨酸;景-精氨酸;竹-组氨酸;骨-谷氨酸 谷氨酰胺;伴-半胱氨酸;天-天冬氨酸天冬酰胺;籁-赖氨酸;苏-苏氨酸;落-酪氨酸;比-

4、吡咯赖氨酸;丝-丝氨酸 孤雁本色,一行斜去浮生转两鬓白,异家龙井难为甘疏水氨基酸:本-苯丙氨酸;色-色氨酸;斜-缬氨酸;浮-脯氨酸;两-亮氨酸;鬓-丙氨酸;异-异亮氨酸;家-甲硫氨酸;甘-甘氨酸,必需氨基酸VS非必需氨基酸,必需氨基酸是指人体必不可少,而机体内又不能合成、必须从食物中补充的氨基酸。如果饮食中经常缺少它们,就会影响健康。必需氨基酸共有10种:Lys、Trp、Phe、Met、Thr、Ile、Leu、Val、Arg和His。人体虽能够合成Arg和His,但合成的量通常不能满足正常的需要,因此这两种氨基酸又被称为半必需氨酸。-Tip MTV Hall 余下的氨基酸则属于非必需氨基酸,动

5、物体自身可以进行有效的合成,它们包括:Ala,Asn、Asp、Gln、Glu、Pro、Ser、Cys、Tyr和Gly。,一组(组氨酸)笨(苯丙氨酸)蛋(蛋氨酸)精(精氨酸)来(赖氨酸)宿(苏氨酸)舍(色氨酸)住(组氨酸)亮(亮氨酸)凉(异亮氨酸)鞋(缬氨酸),氨基酸的名称和缩写,两种非蛋白质氨基酸,氨基酸的缩合反应与肽的形成,氨基酸的手性:D型与L型氨基酸,22种蛋白质氨基酸分子中,除了甘氨酸,均至少含有一个不对称碳原子,因此除甘氨酸以外的21种蛋白质氨基酸都具有手性性质。如果以L型甘油醛为参照物,具有不对称碳原子的氨基酸就有D型和L型两种对映异构体。实验证明,蛋白质分子中的不对称氨基酸都是L

6、型。D型氨基酸仅存在于一些特殊的抗菌肽和某些细菌的细胞壁成分之中,它们不能参入到在核糖体上合成的多肽或蛋白质分子之中。 氨基酸的构型与其旋光方向没有必然的联系。,由于氨基酸既含有碱性的氨基又含有酸性的羧基,因此氨基酸具有特殊的解离性质,但氨基算的碱性和酸性分别弱于单纯的胺和羧酸。一个氨基酸分子内部的酸碱反应使氨基酸能同时带有正负两种电荷,以这种形式存在的离子被称为兼性离子(zwitterions)或两性离子。,特殊的酸碱性质与等电点,氨基酸的两性解离,对于任何一种氨基酸来说,总存在一定的pH值,使其净电荷为零,这时的pH值被称为等电点。pI是一个氨基酸的特征常数。在等电点pH时,氨基酸在电场中

7、,不向两极移动,并且绝大多数处于兼性离子状态,少数可能解离成阳离子和阴离子,但解离成阴、阳离子的趋势和数目相等。,等电点(pI),氨基酸的主要反应性质,氨基酸与DNFB和PITC的反应,所有氨基酸及具有游离-氨基的肽与茚三酮反应都产生蓝紫色物质,只有脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质。,氨基酸与茚三酮的反应,芳香族氨基酸的紫外吸收性质,半胱氨酸的氧化与二硫键的形成,His的R基团中接近生理pH下的解离性质,所有关于氨基酸的分离手段都建立在它们在物理性质(大小)或化学性质(电荷)的差别的基础之上。用于分离、纯化氨基酸的主要手段是电泳和层析。,Ala、Lys和Asp的电泳分离,离子交换层析分离氨基酸的原理,氨基酸的分离与纯化技术,

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