《临床分子生物学检验》课程教学大纲(21页).doc

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1、- 临床分子生物学检验课程教学大纲一、课程基本信息【课程名称】临床分子生物学检验 【英文名称】(Clinical molecular biology technology ) 【课程编码】YXZX3430【课程类别】专业选修课【总 学 时】22学时【总 学 分】1学分【适用专业】医学检验专业【开课院系】医学院二、课程的性质和任务【课程性质】分子生物学是研究生命化学的科学,它在分子水平探讨生命的本质,即研究生物体的分子结构与功能、物质代谢与调节、及其在生命活动中的作用。由于分子生物学越来越多地成为生命科学的共同语言,当今分子生物学已成为生命科学领域的前沿学科。临床分子生物学检验的教学任务主要是介

2、绍核酸与分子标志物、核酸杂交、扩增及序列分析、芯片技术、生物信息分析技术以及应用分子生物学技术较多的有关病毒、细菌、真菌感染的分子生物学检验。课程涵盖最新的有关单基因病检测、肿瘤、线粒体病、染色体病分子检测技术,同时目前临床上技术要求很高的药物相关基因、胚胎植入前以及移植配型和法医物证学的相关分子生物学检验的内容也有详细讲解,对于解决精准医疗的相关问题提供了实验室检测依据。【教学目标】 通过临床分子生物学检验课程的学习,学生将能够:(1)描述生物体(主要是人体)内的主要物质的组成、分子生物学功能。(2)基本掌握核酸杂交技术和核酸扩增技术及核酸序列分析。(3)学会初步通过生物芯片技术和蛋白质组学

3、技术的学习,运用生物信息学技术可以进行简单的数据结果分析。(4)结合分子生物学的基本理论掌握病毒学、细菌感染、真菌等的分子生物学检测。(5)了解有关单基因遗传病、肿瘤、线粒体疾病、染色体病、药物相关性基因、胚胎植入前及移植配型相关技术。【教学任务】(1)要求学生掌握临床分子生物学检验的基础理论、知识和方法。(2)通过实验课,使学生能够了解分子生物学检验基本技术的临床应用。三、课程教学基本要求(一)理论教学内容和基本要求绪论教学内容: 1、临床分子生物学检验的定义及其发展历史。 2、临床分子生物学检验的分子靶标及在病原生物基因组、基因变异、基因多态性、循坏游离核酸检测中的应用。 3、临床分子生物

4、学检验在感染性疾病、遗传性疾病、肿瘤及个体化医学上的发展与应用。 知识点:分子生物学理论和技术的发展趋势及其在医学上的应用。临床分子生物学检验的定义及其发展历史。临床分子生物学检验的分子靶标及在病原生物基因组、基因变异、基因多态性、循坏游离核酸检测中的应用。临床分子生物学检验在感染性疾病、遗传性疾病、肿瘤及个体化医学上的发展与应用。 重点:临床分子生物学检验的定义和基本概念; 难点:临床分子生物学检验的分子靶标及应用;第一章 核酸与分子标志物一、学习目的要求教学内容:1、核酸的结构和功能(DNA的结构和功能、RNA的结构和功能)。2、表观遗传与基因功能,基因突变。3、基因组结构与特征,原核生物

5、、病毒、人类基因组结构特点。4、核酸分子标志物的分类及未来发展。 知识点:核酸分子标志物的分类及发展。DNA的结构和功能、RNA的结构和功能。表观遗传与基因功能,基因突变。基因组结构与特征,原核生物、病毒、人类基因组结构特点。 重点:DNA的结构和功能、RNA的结构和功能。DNA甲基化,蛋白质结构,基因突变的概念及类型。; 难点:原核生物、病毒、人类基因组结构特点;第二章 核酸杂交技术一、学习目的要求教学内容:1、核酸探针的种类、长度、标记方法及检测。2、核酸分子杂交技术中的原位杂交技术、Southern及Northern印记杂交技术。3、长探针和短小寡核苷酸探针杂交的影响因素。 知识点:核酸

6、探针的标记和检测、Southern及Northern印记杂交技术。核酸探针的种类、长度、标记方法及检测。原位杂交技术、Southern及Northern印记杂交技术。长探针和短小寡核苷酸探针杂交的影响因素。 重点:掌握核酸探针的种类及影响杂交的因素。 难点:原位杂交技术。第三章 核酸扩增技术教学内容:1、聚合酶链反应的基本原理、反应过程、扩增体系和扩增条件。2、以PCR为基础的逆转录PCR、巢式PCR、多重PCR、定量PCR、单细胞PCR、原位PCR等技术。3、实时PCR技术的原理及参照系统。4、PCR产物常见的分析技术、临床基因扩增检验的质量管理、实验室设置和人员资质的要求; 知识点:PCR

7、-RELP、等位基因、特异性寡核苷酸、单链构象多态性、聚合酶链反应的基本原理、反应过程、扩增体系和扩增条件。逆转录PCR、巢式PCR、多重PCR、定量PCR、单细胞PCR、原位PCR技术。实时PCR技术的原理及参照系统。PCR产物常见的分析技术、临床基因扩增检验的质量管理、实验室设置和人员资质的要求; 重点:聚合酶链反应的基本原理、实时PCR的原理、临床基因扩增检验的质量管理; 难点:PCR为基础的相关PCR技术。第四章 核酸序列分析教学内容:1、第一代测序技术的原理、染料、反应体系、自动测序仪的使用及测序策略。2、二代测序技术的基本原理和工作流程、特点及应用。3、三代测序技术的发展趋势。 知

8、识点:一代测序技术的原理、染料、反应体系、自动测序仪的使用及测序策略。二代测序技术的基本原理和工作流程、特点及应用。三代测序技术的发展趋势。 重点:二代测序技术的原理、特点及应用 难点:一代测序的原理。第五章 生物芯片技术教学内容:1、DNA芯片的检测原理、DNA芯片技术的特点、DNA芯片检测技术在医学中的应用2、表达谱芯片的技术原理、表达谱芯片技术在医学中的应用。蛋白质芯片的技术原理和在医学中的应用。3、芯片序列捕获技术的原理、芯片序列捕获技术的技术优点及应用。 知识点:DNA芯片的检测原理、特点、医学中的应用。表达谱芯片的技术原理、表达谱芯片技术在医学中的应用。蛋白质芯片的技术原理和在医学

9、中的应用。芯片序列捕获技术的原理、芯片序列捕获技术的技术优点及应用。 重点:DNA芯片的原理和在医学中的应用。 难点:表达谱芯片、蛋白质芯片的技术原理和在医学中的应用。第六章 蛋白质组学技术教学内容:1、蛋白质印记技术的原理、蛋白质印记技术的方法学特点。2、双向凝胶电泳的原理、凝胶上蛋白质的检测、双向凝胶电泳图像分析、双向凝胶电泳方法的特点。3、生物质谱的基本原理、生物质谱技术的特点、生物质谱的应用。 知识点:蛋白质印记技术的原理、方法学特点。双向凝胶电泳的原理、凝胶上蛋白质的检测、双向凝胶电泳图像分析、双向凝胶电泳方法的特点。生物质谱的基本原理、生物质谱技术的特点、生物质谱的应用。 重点:蛋

10、白质印记技术的原理和方法特点。 难点:熟悉生物质谱技术的原理及应用。第七章 生物信息学技术教学内容:1、生物信息数据库查询、文献检索的方法。2、核酸序列的基本分析、核酸序列的比对分析、开放阅读框的分析、启动子预测。3、蛋白质的基本性质分析、蛋白质的结构预测、蛋白质的功能预测。 知识点:生物信息数据库查询、文献检索的方法。核酸序列的基本分析、核酸序列的比对分析、开放阅读框的分析、启动子预测。蛋白质的基本性质分析、蛋白质的结构预测、蛋白质的功能预测。 重点:生物信息数据库查询、文献检索的操作。 难点:核酸数据分析。第八章 病毒感染的分子生物学检验一、学习目的要求教学内容:1、乙肝病毒的基因组结构、

11、分子生物学检验、检测的临床意义。2、人乳头瘤病毒的基因组结构特征、分子生物学检验、检测的临床意义。3、丙型肝炎病毒、人类免疫缺陷病毒、流行性感冒病毒的分子生物学检验及临床意义。 知识点:乙肝病毒的基因组结构、分子生物学检验、检测的临床意义。人乳头瘤病毒的基因组结构特征、分子生物学检验、检测的临床意义。丙型肝炎病毒、人类免疫缺陷病毒、流行性感冒病毒的分子生物学检验及临床意义。 重点:乙型肝炎病毒的检测和临床意义、人乳头瘤病毒的检验及临床意义。 难点:人类免疫缺陷病毒检验及其临床意义。第九章 细菌感染的分子生物学检验教学内容 1、细菌感染的一般检出策略和完整检出策略。 2、结核分枝杆菌的基因组结构

12、特点、分子生物学检验内容和临床意义。 3、淋病奈瑟菌检测、O157型大肠埃希菌分子生物学检验的内容和临床意义。 4、医院细菌感染的特征及分子生物学检测内容。 知识点:细菌感染的一般检出策略和完整检出策略。结核分枝杆菌的基因组结构特点、分子生物学检验内容和临床意义。淋病奈瑟菌检测、O157型大肠埃希菌分子生物学检验的内容和临床意义。医院细菌感染的特征及分子生物学检测内容。 重点:结核分枝杆菌的分子生物学检验及临床意义。 难点:淋病奈瑟菌检测及其临床意义。第十章 真菌与其他病原体的分子生物学检验教学内容:1、白假丝酵母菌和新型隐球菌的分子生物学检验。 2、沙眼衣原体、肺炎衣原体的分子生物学检验及临

13、床意义。 3、肺炎支原体、解脲支原体的分子生物学检验及临床意义。 4、梅毒螺旋体和原虫检测的临床意义。 知识点:白假丝酵母菌和新型隐球菌的分子生物学检验。沙眼衣原体、肺炎衣原体的分子生物学检验及临床意义。肺炎支原体、解脲支原体的分子生物学检验及临床意义。梅毒螺旋体和原虫检测的临床意义。 重点:衣原体和支原体的分子生物学检验和临床意义; 难点:常见真菌、梅毒螺旋体、原虫的分子生物学检验。第十一章 单基因遗传病的分子生物学检验教学内容: 1、单基因遗传病的直接和间接诊断策略。 2、血红蛋白病的检验和临床意义;3、 血友病凝血因子、血友病A和B的分子生物学检验及临床意义;4、了解迪谢内营养不良的相关

14、检验和临床意义。5、了解脆性X综合症的分子生物学检验的临床意义。 知识点:单基因遗传病的直接和间接诊断策略。血红蛋白病的检验和临床意义;血友病凝血因子、血友病A和B的分子生物学检验及临床意义; 重点:血红蛋白病的分子生物学检验和临床意义。 难点:单基因遗传病的诊断策略、血友病的分子生物学检验和临床意义。第十二章 肿瘤的分子生物学检验教学内容:1、肿瘤相关的染色体异常、基因异常、单核苷酸多态性、表观遗传异常。 2、肿瘤的分子生物学检验在乳腺癌、结直肠癌、白血病中的应用。 知识点:肿瘤相关的染色体异常、基因异常、单核苷酸多态性、表观遗传异常。肿瘤的分子生物学检验在乳腺癌、结直肠癌、白血病中的应用。

15、 重点:肿瘤相关的染色体异常。 难点:肿瘤相关的基因异常、表观遗传异常。 第十三章 线粒体疾病的分子生物学检验教学内容:1、线粒体基因组及其表达系统、基因组变异与疾病的相关性。 2、与耳聋相关的mtDNA突变和检测。3、线粒体与leber遗传性视神经病变的检测。 知识点:线粒体与leber遗传性视神经病变及糖尿病的相关性。线粒体基因组及其表达系统、基因组变异与疾病的相关性。与耳聋相关的mtDNA突变和检测。 重点:耳聋相关的mtDNA突变和检测 难点:线粒体基因组及其表达系统、线粒体基因组变异与疾病的关系。 第十四章 染色体疾病的分子生物学检验教学内容: 1、染色体异常、人类染色体数目、结构和

16、形态。 2、染色体病的分类及其特点、常染色体病、性染色体病、染色体微缺失疾病的检测。3、染色体病的分子生物学检验技术。 知识点:染色体异常、人类染色体数目、结构和形态。 染色体病的分类及其特点、常染色体病、性染色体病、染色体微缺失疾病的检测。染色体病的分子生物学检验技术。 重点:染色体病的分类及其特点、常染色体病、性染色体病和染色体微缺失; 难点:染色体与染色体异常。第十五章 药物相关基因检测教学内容: 1、药物基因组学概念、研究范畴、药物相关基因分类。 2、药物作用靶点相关基因、代谢酶基因、药物副反应相关基因。 知识点:药物基因组学概念、研究范畴、药物相关基因分类。药物作用靶点相关基因、代谢

17、酶基因、药物副反应相关基因。 重点:药物作用靶点相关基因、药物代谢酶基因及药物副反应相关基因。 难点:药物基因组学的概念及研究范畴、药物相关基因分类;第十六章 胚胎植入前的分子生物学检验教学内容: 1、试管婴儿、胚胎植入前的相关检验; 2、胚胎取材途径及常用的分子生物学技术。 3、胚胎植入前诊断的应用评价。 知识点:试管婴儿、胚胎植入前的相关检验;胚胎取材途径及常用的分子生物学技术。胚胎植入前诊断的应用评价。 重点:试管婴儿植入前遗传学诊断的检验。 难点:胚胎植入前诊断的技术和方法。第十七章 移植配型及法医物证学的分子生物学检验教学内容: 1、免疫学及分子生物学基础、分子生物学技术在HLA分型

18、中的应用。 2、个体识别和亲子鉴定、遗传学及分子生物学基础。 知识点:免疫学及分子生物学基础、分子生物学技术在HLA分型中的应用。个体识别和亲子鉴定、遗传学及分子生物学基础。 重点:个体识别和亲子鉴定的概念。 难点:移植配型的检验、法医物证学的检验。(二) 实验教学内容和基本要求 实验教学内容及要求见临床分子生物学检验四、 课程教学要求及考核方式1. 教学方法:多媒体+板书。2. 作业及实践环节:乙肝病毒感染的PCR检测。3. 考试形式:期末考核采用闭卷、笔试的方式评定。总评成绩的核算办法是:期末考试占总成绩的80%,平时考核占总成绩的20%。五、学时分配章节主要内容各教学学时分配备注讲授习题

19、见习讨论合计 绪论分子生物学的定义及发展应用0.5学时第 一 章核酸与分子标志物0.5学时第 二 章核酸杂交技术 1学时第 三 章核酸扩增技术 2学时第 四 章核酸序列分析技术 1学时第 五 章生物芯片技术1学时第 六 章蛋白质组学技术1学时第 七 章生物信息学技术1学时第 八 章病毒感染的分子生物学检验2学时第 九 章细菌感染的分子生物学检验1学时第 十 章真菌与其他病原体的分子生物学检验1学时第十一章单基因遗传病的分子生物学检验1学时第十二章肿瘤的分子生物学检验0.5学时第十三章线粒体疾病的分子生物学检验1学时第十四章染色体疾病的分子生物学检验1学时第十五章药物相关基因的分子生物学检验0.5学时第十六章胚胎植入前的分子生物学检验1学时第十七章移植配型及法医物证学的分子生物学检验1学时乙肝病毒感染的PCR检测4学时合计18422六、建议教材及参考书1、建议教材:临床分子生物学检验,吕建新、樊绮诗主编,人民卫生出版社,2015年出版。2、参考书目:生物化学与分子生物学,查锡良,药立波主编,人民卫生出版社,2013年出版;GENE XI,JOCELYN E.KREBS主编,高等教育出版社,第11版,2014年出版。 (编制:杜伟平/审核:李芳芹)第 21 页-

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