PCR扩增实验操作步骤.doc

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1、PCR扩增反应一、实验原理PCR：是一种选择性扩增DNA或RNA的方法，其基本原理是依据体内细胞分裂中的DNA半保留复制机理，以及在体外dNTP分子于不同温度下双链和单链可以互相转变的性质，人为地控制体外合成系统的温度，以促使双链DNA变成单链DNA；单链DNA与人工合成的引物退火，以及在dNTP存在下，耐高温的DNA聚合酶使引物沿单链模板延伸成为双链DNA。PCR反应分3步：变性：通过加热使DNA 双螺旋的氢键断裂，双链解离形成单链DNA；退火：当温度突然降低时，由于模板分子结构较引物要复杂得多，而且反应体系中引物DNA量大大多于模板DNA，使引物和其互补的模板在局部形成杂交链，而模板DNA

2、双链之间互补的机会较少。延伸：在DNA聚合酶和4 种dNTP底物及Mg2+存在的条件下，53的聚合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应，以上3步为一个循环，每一循环的产物可以作为下一个循环的模板，数小时之后，介于两个引物之间的特异性DNA片段得到了大量复制，数量可达21067拷贝。变性延伸退火图 反应历程二、实验材料 1模板：细菌DNA 2 TsgDNA聚合酶 3dNTP混合液410倍浓度PCR缓冲液 52.5mmol/LMgCl2 6RAPD引物：S14 S15 S18 S66 S74 S88 S97 S103 S110 S115 7提取细菌DNA的相关试剂 三、操作步骤 1细菌染色体DN

3、A的提取（见上一组）2RAPD反应体系的配置试剂浓度加入量加 样 顺 序 10倍浓度PCR缓冲液2.5ul氯化镁溶液2.5mmol/L2.5uldNTP混合液各2.5mmol/L2.5ul上游引物2.5umol/L2.5ul下游引物2.5umol/L2.5ul细菌DNA2550ng 2.5ulTsgDNA聚合酶2.5U超纯水10ul总体积25ul3反应程序： 将RAPD反应试剂加入EP管中 轻混后用100ul石蜡油覆盖于反应混合液之上，防止样品在反复加热-冷却的过程中蒸发，盖好盖子 打开PCR反应仪输入以下反应数据l 94 摄氏度预变性5minl 94摄氏度变性40sl 40摄氏度退火40sl

4、 72摄氏度延伸1min将EP管放入仪器开始扩增，循环35次；72摄氏度延伸10min 仪器为Model MyGene 25 Plus 三、注意事项1、PCR反应体系中DNA样品及各种试剂的用量都极少，必须严格注意吸样量的准确性及全部放入反应体系中。2、为避免污染凡是用在PCR反应中的Tip尖、离心管、蒸馏水都要灭菌；吸每种试剂时都要换新的灭菌Tip尖。3、加试剂时先加消毒三蒸水，最后加DNA模板和Taq DNA聚合酶。4、置PCR仪进行PCR反应前，PCR管要盖紧，否则使液体蒸发影响PCR反应。5.引物条件 首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定二聚体或发夹结构，再次

5、引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应（即错配）。2 ）错（聚 引目的在物再夹发定形避物物其密列板与首 应 响蒸体则盖 行 酶合 和 加最毒先试尖 灭换都剂；要馏、离 凡污中系反全性的吸注，极的试各 系反 事意 0氏 次循增开入管 伸0 退0性变 预氏数反入仪 盖盖蒸程却加在止上合反覆石0用混 管 剂应 序程 体 纯 合聚 . / 引 / 引 / 合合 / 溶 冲缓 浓 顺入浓试配系反 组上取提 染 骤 相 取 0 0 引 冲 倍合混 酶 模 料料退延变历应 火延贝 可制量到段性的物两，时数模个为以的循环一为，伸链的起物化合 件的存及底 酶 在较机补双 而交杂局的其引使 模大 中应而得要物子板于降度：火 离链断氢双 热通性：应反 双成模沿酶聚的高下存 及物的合与链 单 链促以统合外为质变相链链度温分 外以机复 分内据原本方 或增性种原验