cDNA文库和基因组文库比较.doc

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1、cDNA文库和基因组文库比较cDNA文库: 以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。基因组文库: 一个生物体的基因组DNA用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体DNA分子中,所有这些插入了基因组DNA片段的载体分子的集合体,将包含这个生物体的整个基因组,也就是构成了这个生物体的基因文库。基因组DNA文库与cDNA文库的比较: 1 基因组DNA文库的优点 相对于cDNA文库,基因组文库的优点: cD

2、NA克隆只能反映着mRNA的分子结构,没有包括基因组的间隔序列, cDNA文库中,不同克隆的分布状态总是反映着mRNA的分布状态,即:高丰度mRNA的cDNA克隆,所占比例较高,分离基因容易;低丰度mRNA的cDNA克隆,所占比例较低,分离基因困难; 从cDNA克隆中,不能克隆到基因组DNA 中的非转录区段序列,不能用于研究基因编码区外侧调控序列的结构与功能. 2 cDNA文库的主要优点:cDNA文库以mRNA为材料,特别适用于某些RNA病毒等的基因组结构研究及有关基因的克隆分离. cDNA文库的筛选比较简单易行. 每一个cDNA文库都含有一种mRNA序列,这样在目的基因的选择中出现假阳性的概

3、率就会比较低,因此阳性杂交信号一般都是有意义的,由此选择出来的阳性克隆将会含有目的基因.cDNA文库可用于在细菌中能进行表达的基因的克隆,直接应用于基因工程操作. cDNA克隆还可用于真核细胞mRNA的结构和功能研究.3 cDNA克隆的主要的缺点:cDNA文库所包含的遗传信息要远远少于基因组DNA文库,并且受细胞来源或发育时期的影响. cDNA文库虽能反映mRNA的分子结构和功能信息,但不能直接获得基因内含子序列和基因编码区外大量调控序列的结构与功能方面信息. 在cDNA文库中,相应于高丰度mRNA的cDNA克隆所占的比例比较高,分离起来比较容易,而相应于低丰度mRNA的cDNA克隆所占的比例

4、则比较低,因此分离也就比较困难.1 因难困比库离比低则比占 的 丰应相容比,较例所 的 度应,文 .息功结序控外编和子基接不但信结的 反库文 影时或源且并 因于远信的所 点的要克究究构的 细于隆 .操工用直克因达进细用文因的有隆克的择的义是号性此较会的阳出的因在列 含文 .易简筛库 .克基究构基的 _ / = & = % 适,材 库 点点库 .功与序侧区编于不列段的 到隆中 难基较占, 的 度低基分高所隆 的 度 . . / _ &-=& %0 / . 即态布 映总布分不库文 列间组包没子 着能克 :点文基 _/ / % % % %=?/ : 相优库 :较文 与 。文的体个构,组个物含,集分载 基些有子 体插切,酶部内制 _/ / _ % % % 0 % 0 % / : 用 组物一库组 / . / = =& % % % %=? . / 库 细该称集 _/. / - % . / 的 部着样扩繁 段细每体转连)粒噬(的当, _/ . / = & ?/. / 转体化催经模为 :文 _ / _ % % /.

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