5.2 多聚酶链式反应扩增DNA片段 课件 (32张PPT).pptx

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1、资料一:刑侦破案杀手锏法医DNA鉴定技术,需要用到大量凶手DNA。资料二:肝炎病毒感染初期症状并不明显,抽取的血液中病毒含量也很少,在检测技术比较落后的时期常常造成误诊。资料三:新型冠状病毒(2019-nCoV)抗体检测、新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测。新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒是用于快速进行体外定性检测新型冠状病毒(RdRp基因、N基因、E基因)的医疗检测用品。它的工作原理是通过提取病人样本中的RNA,进行反转录聚合酶链反应(RT-PCR),通过扩增反应将样本中微量的病毒信息进行放大,最后以荧光的方式读取信号。如果PCR之后信号为阳性,那么就可以认为样本中存

2、在病毒(已经感染),反之表明样本中没有病毒(未感染)。资料四:在刑事侦破案件或遗传病的诊断过程中常需要对样品DNA进行分析,PCR技术能快速扩增DNA片段,在几个小时内复制出上百万份的DNA拷贝,有效地解决了因为样品中DNA含量太低而难以对样品进行分析研究的问题。现在PCR技术已广泛应用于遗传病的诊断、刑侦破案、古生物学、基因克隆和基因测序。,专题5DNA和蛋白质技术课题2多聚酶链式反应扩增DNA片段,华师附中汕尾学校杨宇涛,一、基础知识,(一)PCR原理1.多聚酶链式反应(PCR):一种体外迅速扩增DNA片段的技术,它能以极少量的DNA为模板,在短时间内复制出上百万份的DNA拷贝。2.细胞内

3、的DNA复制(回顾)DNA的基本单位:脱氧核糖核苷酸DNA分子的结构:,含氮碱基,磷酸,5,DNA的羟基(-OH)末端称为3端,而磷酸基团的末端称为5端。,3,3,5,5,一、基础知识,(一)PCR原理2.细胞内的DNA复制(回顾)DNA的基本单位:脱氧核糖核苷酸DNA分子的结构:(两条链)反向平行,双螺旋结构DNA复制的时间:发生在有丝分裂的间期和减数第一次分裂间期DNA复制的场所:细胞核(主要)、线粒体、叶绿体DNA复制的特点:边解旋边复制、半保留复制、多起点复制,一、基础知识,(一)PCR原理2.细胞内的DNA复制(回顾)DNA复制的条件,打开DNA双链,提供DNA复制的模板,合成子链的

4、原料,催化合成DNA子链,工作需要消耗ATP,催化脱氧核苷酸之间形成磷酸二酯键,不能从头开始合成,只能从3端延伸DNA链,子链只从引物3端开始延伸;子链的合成方向总是5端向3端。,使DNA聚合酶能够从引物的3端开始连接脱氧核苷酸,作为DNA复制的起点,一、基础知识,(一)PCR原理3.PCR(体外的DNA复制)的条件DNA分子的热变性原理在80-100的温度范围内,DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性。温度缓慢降低后,两条彼此分离的DNA链重新结合成双链,这个过程称为复性。,一、基础知识,(一)PCR原理3.PCR(体外的DNA复制)的条件耐高温的TaqDNA聚合酶高温解决了打

5、开双链的问题,但是,又导致DNA聚合酶失活的问题,耐高温的TaqDNA聚合酶解决了高温导致DNA聚合酶失活的问题,促成了PCR技术的自动化。自然引物(细胞内的DNA复制):RNA引物人工引物(PCR):DNA单链(主要)或RNA分别与两条模板链相结合的两种引物(引物和引物),一、基础知识,(一)PCR原理3.PCR(体外的DNA复制)的条件控制温度,但不需解旋酶;DNA模板;四种脱氧核苷酸;耐高温的聚合酶(TaqDNA聚合酶);分别与两条模板链相结合的两种引物(引物和引物);需要在一定的缓冲液中进行。,一、基础知识,(二)PCR的反应过程1.PCR的反应步骤:一般要经历三十多次循环,每次循环分

6、为变性、复性和延伸三步2.循环过程变性解旋,94,一、基础知识,(二)PCR的反应过程1.PCR的反应步骤:一般要经历三十多次循环,每次循环分为变性、复性和延伸三步2.循环过程变性解旋,94复性引物与模板链结合,55,不考虑模板链重新结合:模板DNA比引物复杂的多;加入引物的量足够多而模板链数量少;引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。,一、基础知识,(二)PCR的反应过程1.PCR的反应步骤:一般要经历三十多次循环,每次循环分为变性、复性和延伸三步2.循环过程变性解旋,94复性引物与模板链结合,55延伸DNA新链由5端向3端延伸(引物端为新链5端),72(TaqDNA聚合

7、酶最适温度),第1个PCR循环完成后:得到两个拷贝的靶序列,5,引物,5,引物,5,5,模板DNA,2530次循环(复制)后,模板DNA的含量可以扩大100万(220)倍以上。,引物数=新增单链数=22n-2,5,引物,5,引物,5,5,模板DNA,引物,引物,一、基础知识,(二)PCR的反应过程1.PCR的反应步骤:一般要经历三十多次循环,每次循环分为变性、复性和延伸三步2.循环过程变性:解旋,94复性:引物与模板链结合,55延伸:DNA新链由5端向3端延伸,723.PCR的反应结果从第二轮循环开始,前一轮循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物延伸而成的DNA单链会与引物结合,进行DNA的

8、延伸。DNA聚合酶只能特异性地复制处于两个引物之间的DNA序列,等长DNA从第三轮循环开始出现,这段固定长度的序列呈指数扩增。,例:PCR过程与细胞内的DNA复制过程相比,主要有两点不同,它们是()PCR过程需要的引物是人工合成的单链DNA或RNAPCR过程不需要DNA聚合酶PCR过程中DNA的解旋不依靠解旋酶,而是通过对反应温度的控制来实现的PCR过程中,DNA不需要解旋,直接以双链DNA为模板进行复制ABCD,C,例:PCR一般要经过三十多次循环,从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,由引物延伸而成的DNA单链作模板时将()A仍与引物结合进行DNA子链的延伸B与引物结合进行

9、DNA子链的延伸C同时与引物和引物结合进行子链的延伸D无需与引物结合,在酶的作用下从头合成子链,B,解析:当有引物延伸而成的DNA单链做模板时,此单链引物端为5端,与它互补的子链此端为3端,因此新子链应从另一端开始合成,即由引物结合延伸DNA的子链。,二、实验操作,(一)设备与用具1.PCR仪一台能够自动调控温度的仪器2.微量离心管进行PCR反应的场所,一种薄壁塑料管,总容积为0.5ml3.微量移液器用于定量转移PCR配方中的液体,其上的一次性吸液枪头用一次更换一次,(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,按照PCR反应体

10、系的配方将所需用的试剂摆放在实验桌上。p62(PCR反应体系的配方),(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,用微量移液器按照PCR反应体系配方往微量离心管里面加入各种试剂。,(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,过程:盖严微量离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管壁。注意:A.离心管口的盖子一定盖严,防止实验中脱落或液体外溢。B.手指轻轻弹击微量离心管的管壁,目的是使反应液混合均匀。,(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,过程:将微量离心管放在离心机上,离心约10s。目的:使反应液体集中在离心管底部,提高反应效果。,(二)实验操作步骤,二、实验操

11、作,准备移液混合离心反应,将离心管放入PCR仪上,设置好PCR仪的循环程序。,以便增加大分子模板DNA彻底变性的概率,(二)实验操作步骤,二、实验操作,准备移液混合离心反应,【注意事项】,避免外源DNA等因素的污染,隔离操作区,所用微量离心管、枪头、缓冲液以及蒸馏水等在使用必须进行高压灭菌;,分装试剂,简化操作程序,使用一次性枪头。,例:在PCR实验操作中,下列说法不正确的是()A在微量离心管中添加各种试剂时,只需一个枪头B离心管的盖子一定要盖严,防止液体外溢C用手轻弹离心管壁的目的是使反应液充分混合D离心的目的是使反应液集中在离心管部,提高反应效果,A,三、课题成果评价,(一)理论上DNA扩

12、增数目的计算1.一条DNA,复制n次,DNA为2n2.a条DNA,复制n次,DNA为a2n,三、课题成果评价,(二)实验中DNA含量的测定1.原理可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果,DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关2.过程稀释:2LPCR反应液,加入98L蒸馏水,即将样品进行50倍稀释对照调零:以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零,三、课题成果评价,(二)实验中DNA含量的测定1.原理可以通过计算DNA含量来评价扩增的效果,DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰,峰值的大小与DNA的含量有关2.过程测定

13、:取DNA稀释液100L至比色杯中,测定260nm处的光吸收值计算:DNA含量(g/mL)50(260nm的读数)稀释倍数50(常数):1g/ml的DNA在厚度为1cm比色杯中的吸光值为0.02,紫外分光光度计,比色杯,B,1如图表示细胞内DNA复制和细胞外PCR扩增两个过程,两反应过程的条件中相同的是()A模板B原料C酶D能量供应,解析:本题主要考查细胞内DNA复制和细胞外PCR扩增的知识,意在考查考生对细胞内外DNA复制条件的理解。选项A模板不同,胞内DNA复制以整个DNA分子作为模板,PCR扩增却以一段目的DNA作为模板。选项B原料相同,均以4种脱氧核苷酸为原料。选项C酶不相同,胞内DN

14、A解旋需要解旋酶,延伸需要DNA聚合酶等;胞外PCR扩增通过高温解旋而不需要解旋酶,延伸只需热稳定的TaqDNA聚合酶。选项D能量供应不同,胞内DNA复制过程由ATP提供能量,而PCR扩增主要由外界供能。,D,2下列关于PCR的描述中,正确的是()PCR是一种酶促反应引物决定了扩增的特异性扩增DNA利用了热变性的原理扩增的对象是氨基酸序列ABCD,解析:PCR技术的概念是PCR全称为多聚酶链式反应,是一项在生物体外复制特定DNA的核酸合成技术,原理是DNA复制,前提条件是要有一段已知目的基因的核苷酸序列以便合成一对引物,条件还包括模板DNA、四种脱氧核苷酸、一对引物、热稳定DNA聚合酶(Taq酶),具体过程有高温变性:DNA解旋过程;低温复性:引物结合到互补链DNA上;中温延伸:合成子链。PCR扩增中双链DNA解开不需要解旋酶,高温条件下氢键可自动解开。,

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