生物医学信息资源.ppt

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1、2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,生物医学信息资源,范为宇中国中医科学院中医药信息研究所,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,生物医学信息资源,1. 信息资源概述2. 文献信息资源3. 医学专业搜索引擎4. 循证医学信息资源5. 医学影像图谱资源6. 基础医学信息资源7. 临床信息资源8. 药物信息资源9. 公共卫生信息资源,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,1. 信息资源概述,什么是信息资源信息资源是生产与管理过程中所涉及到的一切文件、资料、图像、图表和数据等信息的总称，生物信息资源是生物医学研究与实践过程中所涉及到的一切文件、资料、图像、图表和数据等信息的总称。

2、与人力、财力、物力和自然资源一样同为重要资源，且为发展的战略资源。信息、能源、材料并列为当今世界三大资源。,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,1. 信息资源概述,信息资源的特点能够重复使用，其价值在使用中得到体现； 其利用具有很强的目标导向，不同的信息在不同的用户中体现不同的价值； 具有整合性和可共享性，人们对其检索和利用，不受时间、空间、语言、地域和行业的制约； 是社会财富，任何人无权全部或永久买下信息的使用权；是商品，可以被销售、贸易和交换； 有流动性。,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,1. 信息资源概述,信息资源的发展传统管理阶段：20世纪70年代以前，以图书馆、情

3、报所为代表的文字信息资源管理； 信息管理阶段：20世纪70年代末20世纪末，以计算机应用和数据处理为典型代表； 信息资源管理阶段：本世纪初未来20年，以网络平台、海量数据库、信息处理技术为代表，信息交换、信息共享、信息应用为内容，视信息资源为主要经济资源进行管理的信息资源管理，目的是为了提供知识服务。,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,图书书目，内容检索系统，电子图书期刊题录文摘数据库，全文数据库，电子期刊 引文数据库会议论文题录文摘数据库，全文数据库学位论文题录文摘数据库，全文数据库专利题录文摘数据库，全文数据库标准题录文摘数据库，全文数据库科技成果其它文献,2

4、008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,图书书目检索系统国家图书馆馆藏检索系统WorldCat中国中医科学院图书馆馆藏书目数据库中国医学科学院图书馆馆藏目录中国科学院图书联合目录台湾中医药图书题录数据库北京高校图书馆联合体馆际互借,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,国家图书馆馆藏检索系统 http:/ 免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,WorldCathttp:/www.worldcat.org 可免费查询少量记录,OCLC联合目录数据库（世界上最大的文献联合目录）收录1万多个图书馆12亿资料图书、文章、视频（盒式录相带、DVD）音频（音乐、

5、有声书、盒式录音带、CD、唱片）、乐谱、期刊杂志报纸、互联网资源、计算机文档、地图、档案资料,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国中医科学院图书馆馆藏书目数据库http:/:8001/ 免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国医学科学院图书馆馆藏目录http:/:8090/opac/search.php免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国科学院图书联合目录http:/ 免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,台湾中医药图书题录数据库,通过万方数据系统发布在本院局域网内可查询http:/:8088,2008-6-12,硕士生课程中

6、医药信息学,北京高校图书馆联合体馆际互借,http:/ 文献信息资源,图书搜索引擎（内容检索系统）读秀知识库中华医典中国工具书资源全文数据库中国年鉴资源全文数据库 Google Book SearchSearch Inside! A,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,读秀知识库http:/ 收费系统,中文图书搜索引擎 内容：海量的数据库资源220余万种中文图书元数据（约占1949年以来全部出版中文图书的95以上）150万种图书全文6亿页资料2亿条目次每年10万种以上的图书更新速度功能：对图书的题录信息、目录、全文内容可以进行深度检索可以为读者提供最多50页的原文浏览指定图书的目录页、

7、版权页、前言页、正文的前17页，并提供基于全文的检索。,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国工具书资源全文数据库 我院试用网址： http:/ 我院试用网址： http:/ Book Searchhttp:/,包括新旧书，Old, out of copyright works plus limited view in-copyright books,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,Search Inside! http:/,亚马逊公司包括新旧书，可部分检索受版权保护图书内容，许多书可以全文搜索,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,图书电子图书

8、超星电子图书方正阿帕比电子图书NetLibrary Full-text eBooksNetlibrary 电子听书http:/ 收费系统,收录民国以来我国出版的各类图书，一般有2-3年的时差已收录160万册图形扫描文件，有超星阅览器浏览版及IE浏览版,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,方正阿帕比电子图书http:/ 收费系统,多学科，以2003年以后图书为主，基本无时差450多家出版社参与，收书达30万册以上，无版权问题技术先进，阅读效果好,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,NetLibrary Full-text eBookshttp:/ 可检索图书内容，中国社会科学院图

9、书馆可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,Netlibrary 电子听书 http:/ 收费系统,OCLC产品提供5000 多种语音图书由图书作者、专业解说员或著名演员讲述，在录音工作室专业制作,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,期刊论文题录文摘型检索系统中国中医药期刊文献数据库 http:/中国生物医学文献数据库（CBM）中文生物医学期刊文献数据库（CMCC）国家科学技术图书文献中心 http:/PubMed/MEDLINE EMBASE 数据库 BIOSIS Preview数据库CA 化学文摘数据库IPA国际药学文摘数据库AMED 联合补充医学文献

10、数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国中医药期刊文献数据库 http:/ 我院图书馆电子阅览室免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国生物医学文献数据库http:/ http:/ 免费,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,PubMed/MEDLINEhttp:/pubmed.gov 免费,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,EMBASE 数据库 www.EMBASE.com 医科院图书馆、解放军医学图书馆等可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,BIOSIS生物学文摘数据库BIOSIS Previews Biological Abs

11、tracts Biological Abstracts /RRM（Reports, Review, Meeting）医科院图书馆、解放军医学图书馆等可查CA 化学文摘数据库解放军医学图书馆、国家科学图书馆等可查IPA国际药学文摘数据库医科院图书馆、解放军医学图书馆等可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,期刊论文全文型CNKI数据库 http:/ 万方数据资源系统 http:/:8088/ 中文科技期刊数据库（维普） http:/Socolor http:/ PubMed Central http:/www.pubmedcentral.nih.gov BioMed

12、 Central http:/ Highwire http:/highwire.stanford.edu DOAJ http:/www.doaj.org FreeMedicalJ http:/,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,CNKI数据库 http:/ 我院图书馆电子阅览室免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,万方数据资源系统 http:/:8088/ 我院局域网内免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中文科技期刊数据库（维普） http:/ 收费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,医学文献电子全文开放获取,开放获取 Open Acc

13、ess, OA可以在因特网上免费地获取文献，允许任何的用户阅读、下载、复制、发布、打印和查找。确保作者拥有保护其作品完整性的权利，如果他人引用此作品应表达适当致谢并注明出处。本世纪兴起，2004年我国签署了柏林宣言，表明中国科学界和科研资助机构支持开放获取的原则立场。OA的两种形式OA数据库OA期刊,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,Socolar平台 http:/,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,PubMed Central http:/www.pubmedcentral.nih.gov收录450多种期刊及美国国立卫生研究院NIH资助的研究项目论文,2008-6-12,

14、硕士生课程中医药信息学,BioMed Central http:/ 出版188种生物医学网络版期刊，稿件经严格同行评审,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,DOAJ 开放获取期刊目录 http:/www.doaj.org,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,FreeMedicalJ http:/,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,HighWire出版社 http:/highwire.stanford.edu 收录1155种高影响力质量控制期刊，其中188万篇文献可免费获取,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,利用万方数据资源系统获取外文全文http:/:808

15、8,在该系统外文文献数据库中查询出结果点击“向nstl请求全文”输入用户名、密码（我院图书馆已向各院所发放用户名、密码），点击 “确认”正确填写收件人信息提交后48小时内，该篇文献将发送到读者所留的电子邮箱内。,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,直接向NSTL索取全文http:/,虚拟的科技文献信息服务机构成员单位统一采购、规范加工、联合上网、资源共享，提供理、工、农、医各学科领域的科技文献资源。全文服务方式：购买电子期刊或全文数据库免费提供给科研机构为用户提供全文复制传送,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,期刊电子期刊NSTL提供的338种电子期刊在我

16、院局域网上可免费浏览具体期刊及地址请查看信息所网站通知通告或图书馆网站主页“论文查询”栏目 http:/:8001/ 包括替代与补充医学杂志Journal of Alternative and Complementary Medicine（SCI收录）医学针灸Medical Acupuncture替代补充疗法Alternative & Complementary Therapies等相关期刊,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,期刊引文数据库中国生物医学期刊引文数据库CMCI中国引文数据库CNKI中国科学引文数据库CSCD中文社会科学引文索引CSSCI 美国科学引文

17、索引SCI美国社会科学引文索引SSCIGoogle学术搜索,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国生物医学期刊引文数据库CMCIhttp:/:1012/cdweb/home/home.cbs?firstflag=1我院图书馆电子阅览室免费查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国引文数据库CNKIhttp:/ 收费,1989年以来核心库来源期刊669种，扩展库期刊为374种，论文200万条，引文近900万条 。中国科学技术信息研究所、中国科学图书馆可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中文社会科学引文索引http:/ 收费查询,19982006年2700余种人

18、文社会科学学术期刊 来源文献63余万篇引文文献409余万篇中国科学技术信息研究所、中国社会科学院图书馆、中国科学图书馆、清华大学图书馆等可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,SCI 科学引文索引,Institute for Scientific Information (ISI) 研制SCI核心期刊3781种，SCI扩展期刊6543种（2006年数据），中国刊4种，传统医学刊近10种SCI收录期刊查找 http:/ SCI检索解放军医学图书馆、中国科技信息研究所、国家科学图书馆等可查SCI收录期刊的排名检索期刊引证报告（JCR）解放军医学图书馆、中国科技信息研究所、国家科学图书馆等

19、可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,SCCI 社会科学引文索引,Institute for Scientific Information (ISI) 研制社科期刊文献检索工具，社科期刊文献评价工具SCCI检索解放军医学图书馆、中国科技信息研究所、国家科学图书馆等可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,国际科学引文数据库Database of International Science Citation, DISChttp:/,NSTL研制来源期刊包括多个学科领域的1182种优秀西文期刊，2006年来源数据为33万条，引文数据为1085万条 可查引证文献、参考文献，相关文

20、献（作者相关、关键词相关、参考文献相关）,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,Google 学术搜索http:/,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,会议文献中国医学学术论文数据库CMAChttp:/:1011/cmcc/leadpage.htm 本馆电子阅览室中国会议论文全文数据库（万方）http:/:8088/ 本院局域网西文会议论文全文数据库http:/:8088/ 本院局域网中文会议名录数据库http:/:8088/ 本院局域网西文会议名录数据库http:/:8088/ 本院局域网中国重要会议论文全文数据库（CNKI）国外主要医学文献库大都包括会议文

21、献,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,学位论文CNKI博硕士学位论文全文数据库中国学位论文全文数据库 http:/:8088/ 本院局域网中国学位论文文摘数据库 http:/:8088/ 本院局域网台湾中医药学位论文数据库http:/:8088/ 本院局域网国家图书馆联机公共查询目录中的学位论文查询http:/ 免费题录PQDD北美博硕士学位论文全文数据库解放军医学图书馆可查,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,专利文献国家知识产权局网 http:/中国知识产权网 http:/欧洲专利局网站 http:/美国专利商标局 http:/ww

22、w.uspto.gov世界知识产权组织 http:/www.wipo.org/eng/index.htm日本特许厅网站 http:/www.ipdl.inpit.go.jp/homepg_e.ipdl韩国专利数据库网站 http:/kipris.or.kr/english/index.htm,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国中药专利数据库http:/211.157.104.69/，2.7万记录，中药方剂6万,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国专利数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,中国专利全文数据库（万方) http:/:8088/ 本院局域网,2

23、008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,标准中外标准数据库 http:/:8088/ 本院局域网中外标准全文数据库 http:/:8088/ 本院局域网台湾标准文摘数据库 http:/:8088/ 本院局域网,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,科技成果http:/:8088/ 本院局域网中国科技成果数据库 查新必检库科技成果精品数据库中国重大科技成果数据库科技决策支持数据库国家级科技授奖项目数据库全国科技成果交易信息数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,2. 文献信息资源,中国科技声像资料联合目录数据库 http:/:8088/

24、 本院局域网中国报纸资源全文数据库本院局域网试用http:/ 医学专业搜索引擎,Medical Matrix http:/www.medmatrix.org 临床医学为主,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,3. 医学专业搜索引擎,Medscape http:/ 免费提供临床医学全文文献和继续医学教育资源。 Medical world search http:/用一体化医学语言系统UMLS支持检索，搜索准确性高。Medhunt http:/www.hon.ch/MedHhunt 健康在线基金会，有中文版 Intute: Health and Life Scienceshttp:/www

25、.intute.ac.uk/healthandlifesciences/ 有质量控制Health A to Z http:/ 面向医学专业人员及公众MedWeb http:/www.medweb.emory.edu/medweb/SPT-Home.php 37C医学网医网导航 http:/ 循证医学信息资源,Cochrane图书馆 http:/www.cochrane.org EBM Reviews Ovid公司提供，收费SUMSearch http:/sumsearch.uthscsa.edu 有助于迅速找到临床证据TRIP Database http:/ 网上循证资源大成CRD Datab

26、ase http:/www.crd.york.ac.uk/crdweb/ 英国NHS评价传播中心，疗效评价，经济评价，卫生技术评估Doctors Desk http:/drsdesk.sgul.ac.uk 简单易用 PubMed Clinical Queries http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/clinical.shtml Best Bets http:/www.bestbets.org急救,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,4. 循证医学信息资源临床指南,NGC 美国国家临床指南中心http:/www.guideline

27、.gov 加拿大临床实践指南网站 http:/www.cma.ca/index.cfm/ci_id/54316/la_id/1.htm 美国卫生部健康服务研究评估局网站http:/www.ahrq.gov/clinic/cpgonline.htmNICE英国NHS 国家临床示范研究所http:/www.nice.org.uk/guidance/index.jsp?action=byType&type=2,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,4. 循证医学信息资源卫生技术评估,国际卫生技术评估网http:/www.inahta.org 英国NHS国家健康研究所卫生技术评估网 http:/

28、www.ncchta.org/ 美国NIH 卫生技术评估文档http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=hstat,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,4. 循证医学信息资源临床试验,ClinicalTrials.govhttp:/clinicaltrials.gov PubMed Clinical Querieshttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/clinical.shtml Current Control Trialshttp:/www.controlled- HerbMed h

29、ttp:/www.herbmed.org,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,5. 医学影像图谱资源,美国可视人计划数据库http:/www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html Anatquest 源自可视人的3维解剖学图像http:/anatquest.nlm.nih.gov Anatquest 解剖学影像数据库http:/vhnet.nlm.nih.gov/Anatline/ Insight Toolkit (ITK) 处理医学空间数据的开源软件工具 http:/www.itk.org/ 虚拟器官库Virtual Orga

30、n Library http:/www.anatomy.org/Education/virtual_organ_image_library/default.asp 美国解剖学家协会,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,5. 医学影像图谱资源,Yale Image Processing and Analysis Group http:/noodle.med.yale.edu/intro.html耶鲁图像处理分析组网页，提供分析软件工具、影像数据Whole Brain Atlas http:/www.med.harvard.edu/AANLIB/home.html 哈佛大学提供的正常和病变

31、脑部MRI 和 CT 断层影像 Vesalius http:/ 解剖学和外科学影像，可免费浏览其Clinical FoliosAtlas of Haematology http:/www.hematologica.pl/Atlas3/Angielska/InternetInfo.htm 提供外周血和骨髓细胞的显微镜下图像VisualDx System 症状表征决策支持系统http:/ 医学影像图谱资源,HONmedia http:/www.hon.ch/cgi-bin/HONmedia/ 提供医学图象和影像，分类浏览便利 MDC网站的医学图像图书馆 http:/ 提供急症情况的相片和病例 We

32、bPathInternet病理实验室http:/library.med.utah.edu/WebPath/webpath.html 提供丰富的病理图片,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,6. 基础医学信息资源,分子生物学GenBank http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/ NCBI系列数据库，核酸序列数据库，蛋白质序列数据库，基因组数据库，结构数据库Protein Data Bank, PDB http:/www.rcsb.org/pdb/ 高分子三维结构数据的仓库，美国、欧洲、日本合作ExPASy 蛋白质分析专家系统 http:/us.expasy.org/Exp

33、asyHunt/ 瑞士生物信息研究所创建的蛋白质组学服务器,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,6. 基础医学信息资源,解剖学（见医学影像）生理学PhysioBank 生理学数据库 http:/www.physionet.org/cgi-bin/chart 提供生理学数值及图像，NIH支持下由多个大学研制病理学WebPathInternet病理实验室http:/library.med.utah.edu/WebPath/webpath.html 提供丰富的病理图片,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,6. 基础医学信息资源,微生物ICTV DB 国际病毒分类委员会数据库 http

34、:/www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/index.htm World Data Center for Microorganisms (WDCM) 世界微生物数据中心网站 http:/www.wfcc.info/datacenter.html 提供全面的培养菌、微生物和细胞系数据库遗传学OMIM - Online Mendelian Inheritance in Man 在线人类孟德尔遗传学 http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM 提供遗传疾病信息，与人类基因组计划相伴的表型数据库MGT国际免疫遗传学数据库

35、http:/imgt.cines.fr,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,7. 临床信息资源,中医临床数据库 http:/:8080/DartSubject/index.htm中国中医科学院中医药信息研究所研制疾病诊疗数据库http:/ 中国中医科学院中医药信息研究所研制电子阅览室免费使用,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,7. 临床信息资源,MedlinePlushttp:/medlineplus.gov MICROMEDEX Healthcare Series临床暨循证医药学数据库 提供药物信息、疾病信息、毒物信息、传统医学信息，以及对患者的卫生教育信息等，医科院图书馆

36、可查PDQ - NCIs Comprehensive Cancer Database http:/www.cancer.gov/cancertopics/pdq/cancerdatabase Best Bets http:/www.bestbets.org急救,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,8. 药物信息资源,中国中医药数据库检索系统 电子阅览室可查中药方剂类中国中药数据库 中药药对数据库中国藏药数据库等民族药数据库中国方剂数据库方剂现代应用数据库中国中药化学成分数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,8. 药物信息资源,中国中医药数据库检索系统 电子阅览室可查中药药

37、品类国家药品标准化学药说明书临证用药配伍指南数据库中国藏药药品标准数据库中药成方制剂标准数据库中国药典数据库(2005版) 中国药典(2005年版)临床用药须知中国中药新药品数据库中药非处方药数据库中国国家基本药物数据库中国中成药主要产品产量数据库(1999-2002年) 中成药、中药材进出口品种数据库(2004-2005年) 国家药品标准藏、维、蒙药、中成药说明书数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,8. 药物信息资源,中国中医药数据库检索系统 电子阅览室可查中药不良反应类有毒中药合理应用数据库药物不良反应数据库有毒中药古籍文献数据库结构型数据库中药基础数据库 http:/ 中

38、药药理实验数据仓库http:/ 中药药理数据库化学实验查询http:/ 药物信息资源,中科院上海有机化学研究所化学综合数据库 http:/202.127.145.134/scdb/ 注册后免费查询药物与天然产物数据库药物信息，天然产物信息，专利信息中药与有效成分数据库中药复方查询，中药材查询，中药疾病用药查询，化合物查询NAPRALERT File (NAtural PRoducts ALERT) University of Illinois at Chicago 通过化学文摘社STN数据库查询,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,8. 药物信息资源,IPA 国际药学文摘 医科院、解放

39、军医学图书馆可查Drug Information Fulltext 药物信息全文数据库， 解放军医学图书馆可查RxNorm http:/mor.nlm.nih.gov/download/rxnav/ 临床药物标准命名数据库,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,8. 药物信息资源,MedlinePlusDrug Information http:/www.nlm.nih.gov/medlineplus/druginformation.html免费查询，提供有关药物、补充剂、植物药的全面信息DailyMed http:/dailymed.nlm.nih.gov/dailymed/about.cfm 免费查询，提供有关商品药物的全面信息,2008-6-12,硕士生课程中医药信息学,9. 公共卫生信息资源,卫生统计国家卫生统计数据 http:/202.96.155.170/publicfiles/business/htmlfiles/zwgkzt/pwstj/index.htm 全国中医药统计摘编 http:/ 中国CDC公共卫生基础信息 http:/ 人口数据集死因主题数据集中国人口死因调查数据集,