植物总RNA的提取方法(共4页).doc

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1、精选优质文档-倾情为你奉上实验二、植物总RNA的提取一、实验目的:1.了解真核生物基因组RNA提取的一般原理。2.掌握Trizol提取RNA的方法和步骤。3.了解RNA纯度的检测。二、一般原理Trizol 试剂是由苯酚和硫氰酸胍配制而成的单相的快速抽提总RNA的试剂,在匀浆和裂解过程中,能在破碎细胞、降解蛋白质和其它成分,使蛋白质与核酸分离,失活RNA酶,同时能保持RNA的完整性。在氯仿抽提、离心分离后,RNA处于水相中,将水相转管后用异丙醇沉淀RNATrizol试剂配制苯酚饱和液(38%)-380ml/l硫氰酸胍盐(0.8M-118.16g)硫氰酸铵(0.4M)- 76.12g醋酸钠pH 5

2、(0.1M)- 33.4ml甘油 50ml加水至1L三、材料植物组织四、设备移液器,冷冻高速离心机,低温冰箱,台式高速离心机,液氮罐,陶瓷研钵,1.5ml离心管。五、试剂1、无RNA酶的无菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。3、氯仿:异戊醇 24 : 1 (v/v) 、氯仿。4、异丙醇、无水乙醇、70乙醇。5、Trizol试剂。六、操作步骤1、取植物嫩叶,液氮研磨,每1.5ml tube分装0.1克

3、样品;.每管加入0.5ml Trizol液,迅速混匀,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。、室温下静置5分钟以利于核酸蛋白质复合体的解离、加入0.5ml的氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒,室温静置分钟、 10000r/min离心10分钟、取上清液(水相)转入一新的离心管,加入等体积异丙醇,室温放置10分钟,10000r/min离心10分钟。、弃去上清液,加入至少1ml的70%乙醇,涡旋混匀,4下r/min离心5分钟。、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10分钟,注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度。然后将RNA溶于TE或DEPC处理过的水中,必要时可55-6

4、0水溶10分钟。RNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70七、检测1、DNA的紫外分光光度计检测OD260/OD2801.81OD260=40 g/mL DNA2、甲醛变性琼脂糖电泳检测八、注意事项(1)Trizol、DEPC等有毒,与皮肤接触会引起伤害。操作过程带手套,在通风条件下操作。(2)避免带入RNase进入样品带手套,别用手碰任何与样品接触的物品。使用新的已灭活RNase的塑料器皿与用具。(3)爱护仪器设备,安全操作作业:1、RNA酶的变性或失活剂有那些?其中在总RNA的抽提中主要可用哪几种?2、怎样从总RNA中进行mRNA的分离和纯化。补充:检测方法.此外分光光度计

5、检测值时,相当于含g/mL DNA.时,DNA较纯小于.时,蛋白含量较高,大于.则含有或有断裂植物总RNA的提取规程2007-07-31 00:00:00来源:评论:一、实验目的掌握植物总RNA提取的原理和方法二、实验原理 RNA的提取:破坏细胞膜除去蛋白除去DNA除去盐离子。RNase是一类生物活性极其稳定的酶类,能耐高温、耐酸、耐碱,高压灭菌处理也不能使其完全失活。在提取RNA实验中,要尽量抑制RNase的活性。 DEPC(焦磷酸二乙酯)是很强的 一、实验目的掌握植物总RNA提取的原理和方法二、实验原理RNA的提取:破坏细胞膜除去蛋白除去DNA除去盐离子。RNase是一类生物活性极其稳定的

6、酶类,能耐高温、耐酸、耐碱,高压灭菌处理也不能使其完全失活。在提取RNA实验中,要尽量抑制RNase的活性。DEPC(焦磷酸二乙酯)是很强的RNase抑制剂,可以使RNase的活性丧失。实验中使用的 枪头、 EP管、溶液都要利用0.1%的DEPC处理,Tris不可以用DEPC处理。耐高温的玻璃器皿等要在250烘烤4小时以上。内源的RNase一般利用蛋白质变性剂除去。如苯酚、氯仿、胍、SDS、十二烷基肌氨酸钠等。无水乙醇、高浓度的盐溶液和异丙醇中可以沉淀RNA或DNA,前两者利于沉淀大片段的核酸。注意:DEPC是一种具有致癌嫌疑的有机物!相关操作要在通风橱中完成。 另外DEPC对单链的 DNA或

7、RNA具有破坏作用,利用DEPC处理过的溶液和物品都要经过高温灭活处理后才可以使用(DEPC会分解成水和CO2) 。所有沾染DEPC的液体或物品在使用、遗弃前要高温灭活处理。RNA操作的整个相关实验过程应该在超净台上完成, 操作者应配带口罩、帽子和手套。三、实验材料、器具及药品小麦叶片。高速离心机、研钵、药匙、滤纸、冰盒、口罩、 手套、EP管架、超净工作台、移液器、枪头等。 预冷的乙醇和70%乙醇、液氮、RNA提取试剂盒等。四、实验步骤1.打开超净工作台和紫外灯,用乙醇烧研钵、药匙。2.样品的裂解:液氮中将组织捣成粉末,液氮挥发后加 1 ml A液,立即用移液器抽打均匀。-20冰上静置10mi

8、n,加200l B液,用力颠倒混匀(20余次),冰上静置10min,室温离心12000rpm,10min。3.小心将上层水相移到另一个离心管中,加等体积 B液,颠倒混匀(20余次),冰上静置10min,室温离心12000rpm,10min。4.再小心将上层水相移到另一个离心管中,加等体积 C 液,颠倒混匀,冰上静置30min,室温离心12000rpm,10min。5.弃去上层水相,加400l E液和40l D液,混匀后55水浴5-10min,中间摇动一次。6. 将上清移到另一个中,加1ml预冷的乙醇,颠倒混匀,冰上静置30min,室温离心12000rpm,10min。7.弃去上层水相,加1ml

9、预冷的70%乙醇,转动清洗后倒掉乙醇,在上吹干。8.加20l E液溶解RNA,4保存备用。TRIZOL法提取植物总RNA所用器皿均按RNA提取的常规方法处理。具体程序为:(1):取材料,加液氮研磨,在1.5ml离心管中,分别加1mlTRIZol(Tiangen)或RNAiso(TAKALA)试剂,在离心管中加5-6勺样品,约1g,用力摇15秒(也可涡旋),室温静置15分钟;(2)加200ul的氯仿上下颠倒混匀,室温静置2min;(3)4,12,000g离心15分钟;(4)将上清液移入新的1.5ml离心管,分层,下层红色酚层,界面,上层水相(含RNA);(5)加入等体积的异丙醇沉淀RNA(一般5

10、00-700ul),轻微颠倒,-20沉降1h(此过程可延长)(6)4,12,000g离心15分钟;(7)弃上清,加1ml75%乙醇,轻微颠倒,清洗沉淀,在7,000g,4,离心5分钟;(8)弃上清,风干(不能太干否则RNA很难溶解),加适当体积RNase-freewater溶解。1.2.2总RNA定量与完整性检测(1)定量:测A260nm、A280nm处的吸光值,计算A260/A280的值,以估计总RNA纯度。通过A260的值计算总RNA量。(2)RNA完整性检测:在1.2%普通琼脂糖胶上分离总RNA,若有三条(代表rRNAs)条带清晰,无拖尾的带(如图),则说明总RNA完整,可用于后续实验。28 S: 4800 nt; MW:1.610的6次方18 S : 1900 nt ; MW:6.110的5次方5S : 120 nt; MW:3.610的4次方专心-专注-专业

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